Gen
RBM46
RNA binding motif protein 46
- HGNC 28401↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000151962↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 166863↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 4q32.1
- Koordinater
- Kromosom 4: 154 781 272–154 828 813 (GRCh38)
- Eksoner
- 5 eksoner over 47,5 kb
- Protein
- 533 aminosyrer
- Også kjent som
- MGC27016, CT68
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000281722.8NM_144979.5
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rbm46.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes RBM46 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser RBM46 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er RBM46 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 2,5 kb av genets 47,5 kb, og 1 602 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av RBM46
4Lett
Hvor vanskelig RBM46 er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til RBM46 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.
Det som bidrar til dette: andelen av eksonene til RBM46 i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et variantkall der kan mangle eller være feil. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått 100.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, for eksempel paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått 60.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått 60.0 %
- ReferansedekningHull i referanseassemblyen i nærheten, der det ikke finnes sekvens som lesene kan justeres mot. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått 50.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av samme base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått 30.2,5 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått 20.18 %
En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelige områder å sekvensere.Slik beregnes poengsummenHver stolpe er andelen av eksonbasene til RBM46 i den typen vanskelig område. Hver enkelt type kan gjøre et gen vanskelig alene, og hver ekstra type legger til mindre: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base ligger der leser ikke kan plasseres entydig.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). RBM46-genet: RNA binding motif protein 46. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/rbm46
Dante Labs. RBM46-genet: RNA binding motif protein 46 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/rbm46
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker