Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

PCDHGA12

protocadherin gamma subfamily A, 12

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
5q31.3
Koordinater
Kromosom 5: 141 430 507–141 512 975 (GRCh38)
Eksoner
4 eksoner over 82,5 kb
Protein
932 aminosyrer
Også kjent som
KIAA0588, FIB3, PCDH-GAMMA-A12
Tidligere symboler
CDH21
MANE Select-transkripsjon
ENST00000252085.4NM_003735.3
Lokustype
Annet
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser PCDHGA12 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er PCDHGA12 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 5, med en parentes der PCDHGA12 står. PCDHGA12 og 64 gener i nærheten på kromosom 5, fra 140 971 741 til 141 971 740.Kromosom 55q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 MbPCDHA1: 140 786 136–141 012 351, fremover-strengPCDHA2: 140 794 845–141 012 351, fremover-strengPCDHA3: 140 801 018–141 012 351, fremover-strengPCDHA4: 140 807 037–141 012 347, fremover-strengPCDHA5: 140 821 599–141 012 347, fremover-strengPCDHA6: 140 827 958–141 012 351, fremover-strengPCDHA7: 140 834 231–141 012 351, fremover-strengPCDHA8: 140 841 185–141 012 351, fremover-strengPCDHA9: 140 847 772–141 012 351, fremover-strengPCDHA10: 140 855 883–141 012 351, fremover-strengPCDHA11: 140 868 183–141 012 351, fremover-strengPCDHA12: 140 875 256–141 012 351, fremover-strengPCDHA13: 140 882 079–141 012 347, fremover-strengPCDHA13PCDHAC1: 140 926 299–141 012 351, fremover-strengPCDHAC1PCDHAC2: 140 966 466–141 012 351, fremover-strengPCDHAC2PCDHB1: 141 051 374–141 059 346, fremover-strengPCDHB1PCDHB2: 141 094 597–141 098 703, fremover-strengPCDHB3: 141 100 473–141 103 827, fremover-strengPCDHB3PCDHB4: 141 121 818–141 125 623, fremover-strengPCDHB4PCDHB5: 141 135 206–141 138 615, fremover-strengPCDHB5PCDHB6: 141 150 057–141 153 287, fremover-strengPCDHB6PCDHB7: 141 172 644–141 176 383, fremover-strengPCDHB8: 141 177 790–141 182 369, fremover-strengPCDHB8PCDHB16: 141 182 387–141 186 226, fremover-strengPCDHB9: 141 187 127–141 191 541, fremover-strengPCDHB10: 141 192 353–141 195 647, fremover-strengPCDHB11: 141 199 610–141 203 779, fremover-strengPCDHB12: 141 208 697–141 212 571, fremover-strengPCDHB13: 141 213 919–141 218 979, fremover-strengPCDHB13PCDHB14: 141 223 343–141 227 759, fremover-strengPCDHB14: 141 223 372–141 245 861, fremover-strengPCDHB15: 141 245 395–141 249 365, fremover-strengPCDHB15TAF7: 141 259 884–141 320 784, bakover-strengTAF7SLC25A2: 141 302 635–141 304 049, bakover-strengSLC25A2PCDHGA1: 141 330 495–141 512 977, fremover-strengPCDHGA2: 141 338 754–141 512 977, fremover-strengPCDHGA3: 141 343 819–141 512 977, fremover-strengPCDHGB1: 141 350 083–141 512 977, fremover-strengPCDHGA4: 141 355 004–141 512 977, fremover-strengPCDHGB2: 141 359 971–141 512 977, fremover-strengPCDHGA5: 141 364 162–141 512 977, fremover-strengPCDHGB3: 141 370 237–141 512 977, fremover-strengPCDHGA6: 141 373 878–141 512 977, fremover-strengPCDHGA7: 141 382 702–141 512 977, fremover-strengPCDHGB4: 141 387 698–141 512 977, fremover-strengPCDHGA8: 141 390 157–141 512 977, fremover-strengPCDHGB5: 141 397 942–141 512 977, fremover-strengPCDHGA9: 141 402 765–141 512 977, fremover-strengPCDHGB6: 141 407 989–141 512 977, fremover-strengPCDHGA10: 141 412 981–141 512 977, fremover-strengPCDHGA10PCDHGB7: 141 417 642–141 512 977, fremover-strengPCDHGB7PCDHGA11: 141 421 021–141 512 977, fremover-strengPCDHGA11PCDHGA12: 141 430 507–141 512 975, fremover-strengPCDHGA12PCDHGC3: 141 475 929–141 512 977, fremover-strengPCDHGC4: 141 484 997–141 512 977, fremover-strengPCDHGC5: 141 489 067–141 512 977, fremover-strengDIAPH1: 141 515 016–141 619 194, bakover-strengHDAC3: 141 620 766–141 637 304, bakover-strengHDAC3RELL2: 141 636 950–141 641 065, fremover-strengRELL2FCHSD1: 141 639 296–141 651 430, bakover-strengFCHSD1ARAP3: 141 653 204–141 682 255, bakover-strengARAP3PCDH1: 141 853 090–141 879 246, bakover-strengPCDH1DELE1: 141 923 800–141 952 031, fremover-strengDELE1PCDH12: 141 943 581–141 969 741, bakover-strengPCDH12RNF14: 141 958 305–142 003 016, fremover-strengRNF14Diagram av PCDHGA12: 4 eksoner på fremover-strengen til kromosom 5Ekson 1: 141 430 507–141 433 183, 2 677 baserEkson 2: 141 494 807–141 494 865, 59 baserEkson 3: 141 505 393–141 505 481, 89 baserEkson 4: 141 510 947–141 512 975, 2 029 baser12345′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 4,9 kb av genets 82,5 kb, og 2 799 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av PCDHGA12

13Lett

Hvor vanskelig PCDHGA12 er å sekvensere med korte leser, av 100

Nesten alle eksonene til PCDHGA12 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til PCDHGA12 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet8,9 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner1,4 %
  • GC-innhold18 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). PCDHGA12-genet: protocadherin gamma subfamily A, 12. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/pcdhga12

Vancouver

Dante Labs. PCDHGA12-genet: protocadherin gamma subfamily A, 12 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/pcdhga12

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test