Pereiti prie turinio
Naudokite savo HSA ar FSA lėšas
Sekvenuokite savo genomą (atsidaro naujame skirtuke)

Genas

SLCO6A1

solute carrier organic anion transporter family member 6A1

Santrauka

Citogenetinė vieta
5q21.1
Koordinatės
Chromosoma 5: 102 371 774–102 499 001 (GRCh38)
Eksonai
14 eksonų per 127,2 kb
Baltymas
719 aminorūgščių
Taip pat žinomas kaip
OATP6A1, OATPY, MGC26949, CT48
MANE Select transkriptas
ENST00000506729.6NM_173488.5
Lokuso tipas
Baltymus koduojantys
  • Labai aukštas
  • Patikimas
  • Žemas
  • Labai žemas

Kuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu

Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito SLCO6A1 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.

Kaip išdėstytas SLCO6A1

  • Koduojanti seka
  • Netransliuojama sritis
  • Intronas
  • Transkripcijos kryptis
  • Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Chromosoma 5, su skliaustu, kur yra SLCO6A1. SLCO6A1 ir dar 2 genų šalia jo chromosomoje 5, nuo 101 935 388 iki 102 935 387.Chromosoma 55q21.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3102 Mb102,2 Mb102,4 Mb102,6 Mb102,8 MbSLCO4C1: 102 233 943–102 296 467, atvirkštinė grandinėSLCO4C1SLCO6A1: 102 371 774–102 499 001, atvirkštinė grandinėSLCO6A1PAM: 102 753 981–103 031 149, tiesioginė grandinėPAMSLCO6A1 diagrama: 14 eksonų, chromosoma 5, atvirkštinė grandisEksonas 14: 102 371 774–102 372 123, 350 baziųEksonas 13: 102 373 337–102 373 494, 158 baziųEksonas 12: 102 388 688–102 388 825, 138 baziųEksonas 11: 102 390 981–102 391 045, 65 baziųEksonas 10: 102 399 555–102 399 742, 188 baziųEksonas 9: 102 412 990–102 413 143, 154 baziųEksonas 8: 102 419 826–102 420 021, 196 baziųEksonas 7: 102 438 617–102 438 761, 145 baziųEksonas 6: 102 458 382–102 458 491, 110 baziųEksonas 5: 102 459 656–102 459 777, 122 baziųEksonas 4: 102 475 697–102 475 793, 97 baziųEksonas 3: 102 477 676–102 477 861, 186 baziųEksonas 2: 102 480 177–102 480 434, 258 baziųEksonas 1: 102 498 487–102 499 001, 515 bazių141210864215′3′

Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.

Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).

Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.

Eksonai sudaro 2,7 kb iš 127,2 kb geno; 2 160 šių bazių koduoja baltymą.

SLCO6A1 sekvenavimas

6Lengva

Kaip sunku sekvenuoti SLCO6A1 trumpaisiais skaitiniais, iš 100

Beveik visi SLCO6A1 eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai atvaizduojami aiškiai.

Dar prisideda: kiekvienos rūšies sunkių sričių dalis tarp SLCO6A1 eksonų

  • Atvaizduojamumas0 %
  • Homologija0 %
  • Bendra su chrY0 %
  • Nuorodinės sekos aprėptis0 %
  • Pasikartojimai1,9 %
  • GC kiekis30 %

„Dante Labs“ rezultatas, sudarytas remiantis mūsų pačių tyrimais ir NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojama

Išorinės nuorodos

Iš kur tai paimta

  • HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
  • MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
  • Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.

Cituoti šį puslapį

APA

Dante Labs. (be datos). SLCO6A1 genas: solute carrier organic anion transporter family member 6A1. Pasiekta 2026 m. spalio 19 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/slco6a1

Vancouver

Dante Labs. SLCO6A1 genas: solute carrier organic anion transporter family member 6A1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 19 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/slco6a1

Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.

Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites

Įsigyti savo Genome Test