Pereiti prie turinio
Naudokite savo HSA ar FSA lėšas
Sekvenuokite savo genomą (atsidaro naujame skirtuke)

Genas

SLC38A4

solute carrier family 38 member 4

Santrauka

Citogenetinė vieta
12q13.11
Koordinatės
Chromosoma 12: 46 764 761–46 825 997 (GRCh38)
Eksonai
17 eksonų per 61,2 kb
Baltymas
547 aminorūgščių
Taip pat žinomas kaip
PAAT, NAT3, ATA3, SNAT4
MANE Select transkriptas
ENST00000266579.9NM_018018.5
Lokuso tipas
Baltymus koduojantys
  • Labai aukštas
  • Patikimas
  • Žemas
  • Labai žemas

Kuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu

Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito SLC38A4 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.

Kaip išdėstytas SLC38A4

  • Koduojanti seka
  • Netransliuojama sritis
  • Intronas
  • Transkripcijos kryptis
  • Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Chromosoma 12, su skliaustu, kur yra SLC38A4. SLC38A4 ir dar 3 genų šalia jo chromosomoje 12, nuo 46 295 379 iki 47 295 378.Chromosoma 1212q13.11p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3346,4 Mb46,6 Mb46,8 Mb47 Mb47,2 MbSLC38A2: 46 358 185–46 372 832, atvirkštinė grandinėSLC38A2SLC38A4: 46 764 761–46 825 997, atvirkštinė grandinėSLC38A4AMIGO2: 47 075 707–47 080 929, atvirkštinė grandinėAMIGO2PCED1B: 47 077 945–47 236 667, tiesioginė grandinėPCED1BSLC38A4 diagrama: 17 eksonų, chromosoma 12, atvirkštinė grandisEksonas 17: 46 764 761–46 766 802, 2 042 baziųEksonas 16: 46 768 310–46 768 407, 98 baziųEksonas 15: 46 769 284–46 769 428, 145 baziųEksonas 14: 46 775 049–46 775 173, 125 baziųEksonas 13: 46 776 904–46 777 004, 101 bazėEksonas 12: 46 778 289–46 778 368, 80 baziųEksonas 11: 46 778 501–46 778 776, 276 baziųEksonas 10: 46 779 611–46 779 669, 59 baziųEksonas 9: 46 779 780–46 779 862, 83 baziųEksonas 8: 46 779 949–46 780 030, 82 baziųEksonas 7: 46 784 542–46 784 634, 93 baziųEksonas 6: 46 785 104–46 785 177, 74 baziųEksonas 5: 46 787 916–46 788 031, 116 baziųEksonas 4: 46 788 528–46 788 618, 91 bazėEksonas 3: 46 792 953–46 793 183, 231 bazėEksonas 2: 46 803 603–46 803 794, 192 baziųEksonas 1: 46 825 903–46 825 997, 95 bazių171510515′3′

Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.

Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).

Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.

Eksonai sudaro 4 kb iš 61,2 kb geno; 1 644 šių bazių koduoja baltymą.

SLC38A4 sekvenavimas

1Lengva

Kiek sunku sekvenuoti geną SLC38A4 trumpaisiais skaitiniais, iš 100

Beveik visi geno SLC38A4 eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai aiškiai susiejami su genomu.

Kas prie to prisideda: geno SLC38A4 eksonų dalis kiekvienos rūšies sunkiose srityse

  • Atvaizduojamumas0 %
  • Homologija0 %
  • Pasikartojimai2,9 %
  • GC kiekis5,5 %
  • Nuorodinio genomo padengimas0 %

„Dante Labs“ įvertinimas, sukurtas mūsų tyrimų pagrindu, remiantis NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojama

Išorinės nuorodos

Iš kur tai paimta

  • HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
  • MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
  • Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.

Cituoti šį puslapį

APA

Dante Labs. (be datos). SLC38A4 genas: solute carrier family 38 member 4. Pasiekta 2026 m. spalio 19 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/slc38a4

Vancouver

Dante Labs. SLC38A4 genas: solute carrier family 38 member 4 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 19 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/slc38a4

Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.

Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites

Įsigyti savo Genome Test