Pereiti prie turinio
Naudokite savo HSA ar FSA lėšas
Sekvenuokite savo genomą (atsidaro naujame skirtuke)

Genas

COL22A1

collagen type XXII alpha 1 chain

Santrauka

Citogenetinė vieta
8q24.23-q24.3
Koordinatės
Chromosoma 8: 138 588 235–138 914 041 (GRCh38)
Eksonai
65 eksonų per 325,8 kb
Baltymas
1 626 aminorūgščių
MANE Select transkriptas
ENST00000303045.11NM_152888.3
Lokuso tipas
Baltymus koduojantys
  • Labai aukštas
  • Patikimas
  • Žemas
  • Labai žemas

Kuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu

Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito COL22A1 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.

Kaip išdėstytas COL22A1

  • Koduojanti seka
  • Netransliuojama sritis
  • Intronas
  • Transkripcijos kryptis
  • Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Chromosoma 8, su skliaustu, kur yra COL22A1. COL22A1 ir dar 1 genas šalia jo chromosomoje 8, nuo 138 251 138 iki 139 251 137.Chromosoma 88q24.23-q24.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.3138,4 Mb138,6 Mb138,8 Mb139 Mb139,2 MbFAM135B: 138 130 023–138 497 267, atvirkštinė grandinėFAM135BCOL22A1: 138 588 235–138 914 041, atvirkštinė grandinėCOL22A1COL22A1 diagrama: 65 eksonų, chromosoma 8, atvirkštinė grandisEksonas 65: 138 588 235–138 589 440, 1 206 baziųEksonas 64: 138 591 424–138 591 501, 78 baziųEksonas 63: 138 594 017–138 594 199, 183 baziųEksonas 62: 138 596 904–138 596 970, 67 baziųEksonas 61: 138 598 719–138 598 898, 180 baziųEksonas 60: 138 602 115–138 602 159, 45 baziųEksonas 59: 138 604 734–138 604 769, 36 baziųEksonas 58: 138 606 381–138 606 452, 72 baziųEksonas 57: 138 607 936–138 607 989, 54 baziųEksonas 56: 138 613 867–138 613 920, 54 baziųEksonas 55: 138 616 001–138 616 054, 54 baziųEksonas 54: 138 616 914–138 616 958, 45 baziųEksonas 53: 138 619 455–138 619 508, 54 baziųEksonas 52: 138 623 732–138 623 785, 54 baziųEksonas 51: 138 626 190–138 626 243, 54 baziųEksonas 50: 138 630 695–138 630 748, 54 baziųEksonas 49: 138 635 010–138 635 063, 54 baziųEksonas 48: 138 636 742–138 636 795, 54 baziųEksonas 47: 138 646 629–138 646 682, 54 baziųEksonas 46: 138 649 665–138 649 778, 114 baziųEksonas 45: 138 655 897–138 655 944, 48 baziųEksonas 44: 138 660 436–138 660 480, 45 baziųEksonas 43: 138 662 030–138 662 083, 54 baziųEksonas 42: 138 663 705–138 663 740, 36 baziųEksonas 41: 138 676 558–138 676 635, 78 baziųEksonas 40: 138 679 617–138 679 676, 60 baziųEksonas 39: 138 684 425–138 684 469, 45 baziųEksonas 38: 138 685 208–138 685 312, 105 baziųEksonas 37: 138 688 917–138 688 970, 54 baziųEksonas 36: 138 690 821–138 690 874, 54 baziųEksonas 35: 138 693 646–138 693 699, 54 baziųEksonas 34: 138 694 508–138 694 561, 54 baziųEksonas 33: 138 694 826–138 694 879, 54 baziųEksonas 32: 138 700 112–138 700 144, 33 baziųEksonas 31: 138 703 306–138 703 347, 42 baziųEksonas 30: 138 715 682–138 715 735, 54 baziųEksonas 29: 138 716 227–138 716 289, 63 baziųEksonas 28: 138 716 825–138 716 869, 45 baziųEksonas 27: 138 720 739–138 720 792, 54 baziųEksonas 26: 138 722 036–138 722 089, 54 baziųEksonas 25: 138 724 615–138 724 668, 54 baziųEksonas 24: 138 725 387–138 725 440, 54 baziųEksonas 23: 138 737 524–138 737 577, 54 baziųEksonas 22: 138 751 458–138 751 511, 54 baziųEksonas 21: 138 755 157–138 755 210, 54 baziųEksonas 20: 138 755 482–138 755 511, 30 baziųEksonas 19: 138 755 785–138 755 829, 45 baziųEksonas 18: 138 760 243–138 760 287, 45 baziųEksonas 17: 138 762 413–138 762 466, 54 baziųEksonas 16: 138 775 966–138 776 010, 45 baziųEksonas 15: 138 778 353–138 778 406, 54 baziųEksonas 14: 138 779 509–138 779 562, 54 baziųEksonas 13: 138 780 927–138 780 980, 54 baziųEksonas 12: 138 796 819–138 796 857, 39 baziųEksonas 11: 138 802 872–138 802 934, 63 baziųEksonas 10: 138 807 768–138 807 812, 45 baziųEksonas 9: 138 811 799–138 811 921, 123 baziųEksonas 8: 138 812 939–138 813 019, 81 bazėEksonas 7: 138 821 136–138 821 411, 276 baziųEksonas 6: 138 826 658–138 826 781, 124 baziųEksonas 5: 138 833 039–138 833 150, 112 baziųEksonas 4: 138 844 084–138 844 158, 75 baziųEksonas 3: 138 877 750–138 878 316, 567 baziųEksonas 2: 138 883 082–138 883 244, 163 baziųEksonas 1: 138 913 619–138 914 041, 423 bazių656055504540353025201510515′3′

Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.

Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).

Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.

Eksonai sudaro 6,4 kb iš 325,8 kb geno; 4 881 šių bazių koduoja baltymą.

COL22A1 sekvenavimas

2Lengva

Kiek sunku sekvenuoti geną COL22A1 trumpaisiais skaitiniais, iš 100

Beveik visi geno COL22A1 eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai aiškiai susiejami su genomu.

Kas prie to prisideda: geno COL22A1 eksonų dalis kiekvienos rūšies sunkiose srityse

  • Atvaizduojamumas0 %
  • Homologija0 %
  • Pasikartojimai2 %
  • GC kiekis16 %
  • Nuorodinio genomo padengimas0 %

„Dante Labs“ įvertinimas, sukurtas mūsų tyrimų pagrindu, remiantis NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojama

Išorinės nuorodos

Iš kur tai paimta

  • HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
  • MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
  • Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.

Cituoti šį puslapį

APA

Dante Labs. (be datos). COL22A1 genas: collagen type XXII alpha 1 chain. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/col22a1

Vancouver

Dante Labs. COL22A1 genas: collagen type XXII alpha 1 chain [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/col22a1

Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.

Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites

Įsigyti savo Genome Test