Genas
BTF3L4
basic transcription factor 3 like 4
- HGNC 30547↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000134717↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 91408↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 1p32.3
- Koordinatės
- Chromosoma 1: 52 056 295–52 090 716 (GRCh38)
- Eksonai
- 6 eksonų per 34,4 kb
- Baltymas
- 158 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- MGC23908
- MANE Select transkriptas
- ENST00000313334.13NM_152265.5
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/btf3l4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite BTF3L4 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito BTF3L4 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.
Kaip išdėstytas BTF3L4
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,5 kb iš 34,4 kb geno; 477 šių bazių koduoja baltymą.
BTF3L4 sekvenavimas
18Vidutiniška
Kaip sunku sekvenuoti BTF3L4 trumpaisiais skaitiniais, iš 100
0 · Lengva100 · Sunku
Dalis BTF3L4 eksonų yra vietose, kur trumpieji skaitiniai gali praleisti arba neteisingai priskirti pakeitimą.
Prie to prisideda kiekvienos sunkių sričių rūšies dalis tarp BTF3L4 eksonų
- AtvaizduojamumasRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negalima vienareikšmiškai priskirti, todėl ten iškvietimas gali būti praleistas arba neteisingas. Svoris 35 %.17 %
- HomologijaSegmentinės dubliakacijos: genomo kopijos kitur, pavyzdžiui, paralogai ir pseudogenai, kurių identiškumas 90 % ar didesnis. Svoris 30 %.36 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido seka, kuriais skaitiniai slysta ir kurių gali neaprėpti. Svoris 15 %.5,9 %
- GC kiekisLangai, kuriuose G ir C yra mažiau nei 25 % arba daugiau nei 65 %, bibliotekos paruošimo metu aprėpiami silpnai. Svoris 10 %.1,9 %
- Nuorodinės sekos aprėptisNetoliese esantys nuorodinės sekos surinkinio tarpai, kur skaitiniams nėra su kuo susilyginti. Svoris 10 %.0 %
Dante Labs balas, sukurtas remiantis mūsų pačių tyrimu, paremtu NIST Genome in a Bottle sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojamas balasKiekviena juosta rodo, kokia BTF3L4 eksonų bazių dalis yra tokioje sunkioje srityje. Balas sveria juos pagal tai, kiek kiekvienas kainuoja trumpųjų skaitinių iškvietimui: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokią, 100, kai kiekviena bazė patenka į visas.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Klinikinė
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). BTF3L4 genas: basic transcription factor 3 like 4. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/btf3l4
Dante Labs. BTF3L4 genas: basic transcription factor 3 like 4 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/btf3l4
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites