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Gene

SCAF1

SR-related CTD associated factor 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
19q13.3-q13.4
Coordinate
Cromosoma 19: 49.642.209–49.658.642 (GRCh38)
Esoni
11 esoni su 16,4 kb
Proteina
1312 amminoacidi
Noto anche come
SR-A1, FLJ00034
Trascritto MANE Select
ENST00000360565.8NM_021228.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SCAF1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SCAF1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 19, con una parentesi dove si trova SCAF1. SCAF1 e 44 geni nelle vicinanze sul cromosoma 19, da 49.150.426 a 50.150.425.Cromosoma 1919q13.3-q13.4p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4349,2 Mb49,4 Mb49,6 Mb49,8 Mb50 MbPPFIA3: 49.119.401–49.151.027, filamento direttoPPFIA3HRC: 49.151.014–49.155.441, filamento inversoHRCTRPM4: 49.157.737–49.211.841, filamento direttoTRPM4SLC6A16: 49.289.638–49.325.215, filamento inversoSLC6A16CD37: 49.335.171–49.343.335, filamento direttoCD37TEAD2: 49.340.389–49.362.729, filamento inversoTEAD2DKKL1: 49.361.783–49.375.120, filamento direttoDKKL1KASH5: 49.388.219–49.417.990, filamento direttoKASH5PTH2: 49.422.419–49.423.660, filamento inversoPTH2GFY: 49.423.749–49.428.987, filamento direttoGFYSLC17A7: 49.429.399–49.443.197, filamento inversoPIH1D1: 49.446.291–49.453.537, filamento inversoALDH16A1: 49.453.146–49.471.052, filamento diretto: 49.462.752–49.486.231, filamento direttoFLT3LG: 49.474.150–49.486.233, filamento direttoFLT3LGRPL13A: 49.487.510–49.493.057, filamento direttoRPL13ARPS11: 49.496.233–49.499.903, filamento direttoRPS11FCGRT: 49.506.806–49.526.917, filamento direttoFCGRTRCN3: 49.526.534–49.579.703, filamento direttoRCN3NOSIP: 49.555.207–49.592.927, filamento inversoNOSIPPRRG2: 49.580.646–49.591.004, filamento direttoPRRG2PRR12: 49.591.108–49.626.439, filamento direttoPRR12RRAS: 49.634.555–49.640.211, filamento inversoRRASSCAF1: 49.642.209–49.658.642, filamento direttoSCAF1IRF3: 49.659.569–49.665.864, filamento inversoIRF3BCL2L12: 49.664.622–49.673.917, filamento direttoBCL2L12PRMT1: 49.675.786–49.689.029, filamento direttoADM5: 49.688.953–49.690.575, filamento direttoADM5CPT1C: 49.690.898–49.713.733, filamento direttoTSKS: 49.739.753–49.763.329, filamento inversoTSKSAP2A1: 49.766.912–49.807.114, filamento direttoAP2A1FUZ: 49.806.866–49.817.376, filamento inversoFUZMED25: 49.818.269–49.840.384, filamento direttoMED25PTOV1: 49.850.735–49.860.744, filamento direttoPTOV1PNKP: 49.859.882–49.878.351, filamento inversoPNKPAKT1S1: 49.869.023–49.879.470, filamento inversoAKT1S1TBC1D17: 49.877.501–49.888.751, filamento direttoIL4I1: 49.889.654–49.929.926, filamento inversoIL4I1NUP62: 49.906.825–49.929.926, filamento inversoNUP62: 49.909.501–49.958.391, filamento inversoATF5: 49.923.910–49.933.935, filamento direttoATF5SIGLEC11: 49.948.910–49.961.172, filamento inversoSIGLEC16: 49.969.600–49.975.819, filamento direttoVRK3: 49.974.537–50.025.946, filamento inversoVRK3ZNF473: 50.025.714–50.053.414, filamento direttoZNF473Diagramma di SCAF1: 11 esoni sul filamento diretto del cromosoma 19Esone 1: 49.642.209–49.642.242, 34 basiEsone 2: 49.645.021–49.645.134, 114 basiEsone 3: 49.645.354–49.645.411, 58 basiEsone 4: 49.646.108–49.646.202, 95 basiEsone 5: 49.646.526–49.646.626, 101 basiEsone 6: 49.646.715–49.646.830, 116 basiEsone 7: 49.650.868–49.653.705, 2838 basiEsone 8: 49.654.349–49.654.431, 83 basiEsone 9: 49.654.652–49.654.870, 219 basiEsone 10: 49.657.761–49.657.889, 129 basiEsone 11: 49.658.208–49.658.642, 435 basi1246810115′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,2 kb dei 16,4 kb del gene; 3939 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SCAF1: SR-related CTD associated factor 1. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/scaf1

Vancouver

Dante Labs. Gene SCAF1: SR-related CTD associated factor 1 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/scaf1

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