Variante
GLA C52S
NM_000169.3(GLA):c.155G>C (p.Cys52Ser)
- p.Cys52Ser
- p.C52S
- rs869312256
- Classificazione ClinVar
- Patogena
- Stato della revisione
- 2 stelle su 4criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto
- Ultima valutazione
- 8 settembre 2026
Dati aggiornati alla versione 2026-10-12 di ClinVar · Versione dei dati di Dante Labs 2026.10.19-9814e911Dati modificati l'ultima volta il 19 ottobre 2026
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C52S è una variante missense in GLA: modifica un singolo amminoacido nella proteina codificata dal gene. ClinVar la classifica come patogena per Fabry Disease (criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto).
Classificazioni ClinVar
| Condizione | Classificazione | Stato della revisione | Invii | Ultima valutazione |
|---|---|---|---|---|
| Fabry DiseaseClinVar VCV004087280 (si apre in una nuova scheda) | Patogena | 2 stelle su 4criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | 3 invii | 8 settembre 2026 |
Classificazioni come registrate da ClinVar nella versione 2026-10-12. ClinVar le aggiorna man mano che le evidenze vengono esaminate.
Criteri ACMG/AMP
I criteri ACMG/AMP soddisfatti da C52S, in base all'effetto previsto su GLA, gnomAD e ClinVar.
| Criterio | Forza | Punti | Basato su |
|---|---|---|---|
| PS1Stesso cambiamento di amminoacido di una variante patogenica | Forte | +4 | p.Cys52Ser nello stesso amminoacido, ClinVar: Patogena (criteri forniti, singolo sottomittente) |
| PM2Assente o molto rara nelle banche dati di popolazione | Di supporto | +1 | Non riscontrata in esomi gnomAD e genomi gnomAD |
| PP5Una fonte attendibile la riporta come patogenica | Di supporto | Non conteggiato | ClinVar: Patogena (criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto) |
Solo sulla base di questi criteri: +5 punti, significato incerto.
Valutazione automatica, senza evidenze funzionali, computazionali o familiari. Non si tratta di una classificazione clinica.
Frequenza nella popolazione
Quanto spesso C52S si riscontra tra le persone i cui esomi e genomi sono raccolti in gnomAD 4.1.
| Dataset | Frequenza allelica | Conteggio alleli | Omozigoti | Più comune in |
|---|---|---|---|---|
| esomi gnomAD | Non riscontrato | 0 su 0 | 0 | |
| genomi gnomAD | Non riscontrato | 0 su 0 | 0 |
Dati da gnomAD 4.1, pubblicati così come gnomAD li fornisce. I gruppi sono gruppi di ascendenza genetica così come gnomAD li inferisce. Descrivono la variante nelle popolazioni di gnomAD, non il risultato di nessuna persona.
Dove si trova in GLA
C52S si trova nell'esone 1 dei 7 della trascrizione MANE Select di GLA, NM_000169.3.
Dettagli molecolari
| Gene | GLA |
|---|---|
| Trascritto | NM_000169.3MANE Select |
| Variazione del DNA codificante (HGVS c.) | c.155G>C |
| Variazione proteica (HGVS p.) | p.Cys52Serp.C52S |
| Conseguenza prevista | Missensomissense_variant (si apre in una nuova scheda) |
| Impatto previsto | Moderato |
| Posizione (GRCh38) | chrX:101407749 C>G |
| Posizione (GRCh37) | chrX:100662737 C>G |
| ID dbSNP | rs869312256 (si apre in una nuova scheda) |
| ID di variazione ClinVar | VCV004087280 (si apre in una nuova scheda) |
| ID allele ClinVar | 224118 |
| Nome in ClinVar | NM_000169.3(GLA):c.155G>C (p.Cys52Ser) |
GLA C52S in altri database
Report che analizzano questa variante (2)
Questi report sulle condizioni di Genome Test includono C52S tra le varianti analizzate.
| Report | Condizioni | Ereditarietà |
|---|---|---|
| Fabry Disease | Fabry Disease | Recessiva legata all'X |
| Lysosomal Storage Disease | Lysosomal storage disease (other and unspecified types) |
Altre varianti in GLA
- A15EPatogena2 stelle su 4
- A20DPatogena/probabilmente patogena2 stelle su 4
- A20Gfs*2Patogena2 stelle su 4
- A29Gfs*2Patogena2 stelle su 4
- A31VProbabilmente patogena2 stelle su 4
- A37PPatogena/probabilmente patogena2 stelle su 4
- A37TProbabilmente patogena2 stelle su 4
- A97VPatogena/probabilmente patogena2 stelle su 4
- A121PProbabilmente patogena2 stelle su 4
- A135VPatogena2 stelle su 4
Limitazioni
Questa pagina descrive informazioni pubblicamente disponibili su una variante genetica. Non costituisce una diagnosi e non dice nulla sul fatto che Lei o altre persone portino questa variante.
Le classificazioni provengono da ClinVar e cambiano man mano che vengono esaminate nuove evidenze. Una classificazione riportata qui può differire da quella attuale in ClinVar o da quella indicata da un laboratorio.
Il sequenziamento dell'intero genoma con letture corte può non rilevare o interpretare erroneamente alcune varianti, in particolare in tratti di DNA ripetuti o molto simili tra loro e in inserzioni, delezioni o riarrangiamenti di grandi dimensioni.
Se ha domande su una variante presente nei Suoi risultati o in quelli della Sua famiglia, si rivolga a un consulente genetico o al proprio medico.
Fonti e crediti
- Classificazioni da ClinVar (versione 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Termini delle condizioni dal Mondo Disease Ontology (versione 2026-10-06), utilizzati secondo la licenza CC BY 4.0.
- Simboli e nomi dei geni dell'HUGO Gene Nomenclature Committee (versione 2026-10-16).
- Identificatori degli alleli dal ClinGen Allele Registry (versione 2026-10-19-c4908f54).
- Identificatori SNP di riferimento da dbSNP (versione b157), National Center for Biotechnology Information.
- Collegamenti gene-malattia dal Gene Curation Coalition, GenCC (versione 2026-10-19).
- Regioni difficili dal Genome in a Bottle Consortium (versione v3.6).
- Trascritti da MANE (versione v1.5), NCBI ed EMBL-EBI.
- Conseguenze previste da mehari (versione 0.11.0), con modelli di trascritti da cdot.
- Costruito dalla release dei dati Dante Labs 2026.10.19-9814e911 del 19 ottobre 2026.
Citi questa pagina
Dante Labs. (19 ottobre 2026). GLA C52S (c.155G>C, rs869312256) (Versione 2026.10.19-9814e911). Recuperato il 21 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/genes/gla/variants/c52s
Dante Labs. GLA C52S (c.155G>C, rs869312256) [Internet]. Versione 2026.10.19-9814e911. 19 ottobre 2026 [consultato il 21 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/genes/gla/variants/c52s
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