Variante
GAMT V110F
NM_000156.6(GAMT):c.328G>T (p.Val110Phe)
- p.V110F:GTC>TTC
- p.Val110Phe
- p.V110F
- rs753198836
- Classificazione ClinVar
- Probabilmente patogena
- Stato della revisione
- 3 stelle su 4revisionata da un panel di esperti
- Ultima valutazione
- 18 aprile 2025
- Panel di esperti
- ClinGen Cerebral Creatine Deficiency Syndromes Variant Curation Expert Panel, ClinGen
Dati aggiornati alla versione 2026-10-12 di ClinVar · Versione dei dati di Dante Labs 2026.10.19-9814e911Dati modificati l'ultima volta il 19 ottobre 2026
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page$variant$nameRiepilogo
V110F è una variante missense in GAMT: modifica un singolo amminoacido nella proteina codificata dal gene. ClinVar la classifica come probabilmente patogena per guanidinoacetate methyltransferase deficiency (revisionata da un panel di esperti).
Classificazioni ClinVar
| Condizione | Classificazione | Stato della revisione | Invii | Ultima valutazione |
|---|---|---|---|---|
| guanidinoacetate methyltransferase deficiencyClinVar VCV000205580 (si apre in una nuova scheda) | Probabilmente patogena | 3 stelle su 4revisionata da un panel di esperti | 1 invio | 18 aprile 2025 |
Classificazioni come registrate da ClinVar nella versione 2026-10-12. ClinVar le aggiorna man mano che le evidenze vengono esaminate.
Criteri ACMG/AMP
I criteri ACMG/AMP soddisfatti da V110F, in base all'effetto previsto su GAMT, gnomAD e ClinVar.
| Criterio | Forza | Punti | Basato su |
|---|---|---|---|
| PM2Assente o molto rara nelle banche dati di popolazione | Di supporto | +1 | 0,0012% in genomi gnomAD |
| PP5Una fonte attendibile la riporta come patogenica | Di supporto | Non conteggiato | ClinVar: Probabilmente patogena (revisionata da un panel di esperti) |
Solo sulla base di questi criteri: +1 punto, significato incerto.
Valutazione automatica, senza evidenze funzionali, computazionali o familiari. Non si tratta di una classificazione clinica.
Frequenza nella popolazione
Quanto spesso V110F si riscontra tra le persone i cui esomi e genomi sono raccolti in gnomAD 4.1.
| Dataset | Frequenza allelica | Conteggio alleli | Omozigoti | Più comune in |
|---|---|---|---|---|
| esomi gnomAD | 0,00062%1 su 162.229 | 9 su 1.460.062 | 0 | Europea (non finlandese): 0,00072% |
| genomi gnomAD | 0,002%1 su 50.720 | 3 su 152.160 | 0 | Europea (non finlandese): 0,0044% |
Dati da gnomAD 4.1, pubblicati così come gnomAD li fornisce. I gruppi sono gruppi di ascendenza genetica così come gnomAD li inferisce. Descrivono la variante nelle popolazioni di gnomAD, non il risultato di nessuna persona.
Dove si trova in GAMT
V110F si trova nell'esone 3 dei 6 della trascrizione MANE Select di GAMT, NM_000156.6.
Dettagli molecolari
| Gene | GAMT |
|---|---|
| Trascritto | NM_000156.6MANE Select |
| Variazione del DNA codificante (HGVS c.) | c.328G>T |
| Variazione proteica (HGVS p.) | p.Val110Phep.V110F |
| Conseguenza prevista | Missensomissense_variant (si apre in una nuova scheda)exonic_splice_region_variant (si apre in una nuova scheda) |
| Impatto previsto | Moderato |
| Posizione (GRCh38) | chr19:1399587 C>A |
| Posizione (GRCh37) | chr19:1399586 C>A |
| ID dbSNP | rs753198836 (si apre in una nuova scheda) |
| ID di variazione ClinVar | VCV000205580 (si apre in una nuova scheda) |
| ID allele ClinVar | 203542 |
| ID di ClinGen Allele Registry | CA314806 (si apre in una nuova scheda) |
| Nome in ClinVar | NM_000156.6(GAMT):c.328G>T (p.Val110Phe) |
| Altri nomi | p.V110F:GTC>TTC |
GAMT V110F in altri database
Report che analizzano questa variante (1)
Questi report sulle condizioni di Genome Test includono V110F tra le varianti analizzate.
| Report | Condizioni | Ereditarietà |
|---|---|---|
| Cerebral Creatine Deficiency Syndromes | Cerebral Creatine Deficiency Syndrome |
Altre varianti in GAMT
- A22Gfs*63Patogena3 stelle su 4
- A54PProbabilmente patogena3 stelle su 4
- A74PProbabilmente patogena3 stelle su 4
- A75VPatogena3 stelle su 4
- A156DProbabilmente patogena3 stelle su 4
- c.1A>GProbabilmente patogena3 stelle su 4
- c.114C>TProbabilmente patogena3 stelle su 4
- c.158_181+7delPatogena3 stelle su 4
- c.327+43G>AProbabilmente patogena3 stelle su 4
- c.327G>APatogena3 stelle su 4
Limitazioni
Questa pagina descrive informazioni pubblicamente disponibili su una variante genetica. Non costituisce una diagnosi e non dice nulla sul fatto che Lei o altre persone portino questa variante.
Le classificazioni provengono da ClinVar e cambiano man mano che vengono esaminate nuove evidenze. Una classificazione riportata qui può differire da quella attuale in ClinVar o da quella indicata da un laboratorio.
Il sequenziamento dell'intero genoma con letture corte può non rilevare o interpretare erroneamente alcune varianti, in particolare in tratti di DNA ripetuti o molto simili tra loro e in inserzioni, delezioni o riarrangiamenti di grandi dimensioni.
Se ha domande su una variante presente nei Suoi risultati o in quelli della Sua famiglia, si rivolga a un consulente genetico o al proprio medico.
Fonti e crediti
- Classificazioni da ClinVar (versione 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Termini delle condizioni dal Mondo Disease Ontology (versione 2026-10-06), utilizzati secondo la licenza CC BY 4.0.
- Simboli e nomi dei geni dell'HUGO Gene Nomenclature Committee (versione 2026-10-16).
- Identificatori degli alleli dal ClinGen Allele Registry (versione 2026-10-19-c4908f54).
- Identificatori SNP di riferimento da dbSNP (versione b157), National Center for Biotechnology Information.
- Collegamenti gene-malattia dal Gene Curation Coalition, GenCC (versione 2026-10-19).
- Regioni difficili dal Genome in a Bottle Consortium (versione v3.6).
- Trascritti da MANE (versione v1.5), NCBI ed EMBL-EBI.
- Conseguenze previste da mehari (versione 0.11.0), con modelli di trascritti da cdot.
- Costruito dalla release dei dati Dante Labs 2026.10.19-9814e911 del 19 ottobre 2026.
Citi questa pagina
Dante Labs. (19 ottobre 2026). GAMT V110F (c.328G>T, rs753198836) (Versione 2026.10.19-9814e911). Recuperato il 21 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/genes/gamt/variants/v110f
Dante Labs. GAMT V110F (c.328G>T, rs753198836) [Internet]. Versione 2026.10.19-9814e911. 19 ottobre 2026 [consultato il 21 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/genes/gamt/variants/v110f
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