Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

TBC1D4

TBC1 domain family member 4

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
13q22.2
Koordináták
13. kromoszóma: 75 283 503–75 482 169 (GRCh38)
Exonok
21 exon, összesen 198,7 kb
Fehérje
1298 aminosav
Más néven ismert
KIAA0603, AS160, DKFZp779C0666
MANE Select transzkriptum
ENST00000377636.8NM_014832.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) TBC1D4 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A TBC1D4 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
13. kromoszóma, a TBC1D4 helyét zárójel jelöli. A TBC1D4 és környékén 3 gén a 13. kromoszómán, 74 882 836–75 882 835 között.13. kromoszóma13q22.2p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3475 Mb75,2 Mb75,4 Mb75,6 Mb75,8 MbTBC1D4: 75 283 503–75 482 169, fordított szálTBC1D4COMMD6: 75 525 214–75 549 439, fordított szálCOMMD6UCHL3: 75 549 483–75 610 084, előre szálUCHL3LMO7: 75 620 434–75 859 870, előre szálLMO7A TBC1D4 ábrája: 21 exon a(z) 13. kromoszóma fordított szálán21. exon: 75 283 503–75 287 025, 3523 bázis20. exon: 75 288 934–75 289 110, 177 bázis19. exon: 75 292 102–75 292 271, 170 bázis18. exon: 75 294 854–75 295 013, 160 bázis17. exon: 75 299 330–75 299 574, 245 bázis16. exon: 75 302 243–75 302 401, 159 bázis15. exon: 75 306 313–75 306 471, 159 bázis14. exon: 75 309 942–75 310 151, 210 bázis13. exon: 75 312 738–75 312 898, 161 bázis12. exon: 75 320 014–75 320 037, 24 bázis11. exon: 75 324 237–75 324 401, 165 bázis10. exon: 75 326 197–75 326 423, 227 bázis9. exon: 75 327 752–75 327 826, 75 bázis8. exon: 75 336 921–75 337 040, 120 bázis7. exon: 75 341 125–75 341 235, 111 bázis6. exon: 75 341 496–75 341 587, 92 bázis5. exon: 75 349 170–75 349 302, 133 bázis4. exon: 75 356 147–75 356 251, 105 bázis3. exon: 75 359 769–75 359 858, 90 bázis2. exon: 75 362 026–75 362 607, 582 bázis1. exon: 75 481 270–75 482 169, 900 bázis2115′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 198,7 kb-jából 7,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3897 bázis kódolja a fehérjét.

TBC1D4 szekvenálása

2Könnyű

Mennyire nehéz a TBC1D4 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A TBC1D4 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a TBC1D4 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések4,2%
  • GC-tartalom15%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). TBC1D4 gén: TBC1 domain family member 4. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/tbc1d4

Vancouver

Dante Labs. TBC1D4 gén: TBC1 domain family member 4 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/tbc1d4

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet