Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LMO7

LIM domain 7

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
13q22.2
Koordináták
13. kromoszóma: 75 636 330–75 859 866 (GRCh38)
Exonok
31 exon, összesen 223,5 kb
Fehérje
1631 aminosav
Más néven ismert
FBX20, KIAA0858
Korábbi jelölések
FBXO20
MANE Select transzkriptum
ENST00000377534.8NM_001306080.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LMO7 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LMO7 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
13. kromoszóma, a LMO7 helyét zárójel jelöli. A LMO7 és környékén 3 gén a 13. kromoszómán, 75 248 098–76 248 097 között.13. kromoszóma13q22.2p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3475,4 Mb75,6 Mb75,8 Mb76 Mb76,2 MbTBC1D4: 75 283 488–75 482 660, fordított szálTBC1D4COMMD6: 75 525 214–75 549 439, fordított szálCOMMD6UCHL3: 75 549 483–75 610 084, előre szálUCHL3LMO7: 75 636 330–75 859 866, előre szálLMO7A LMO7 ábrája: 31 exon a(z) 13. kromoszóma előre szálán1. exon: 75 636 330–75 636 726, 397 bázis2. exon: 75 713 182–75 713 252, 71 bázis3. exon: 75 727 029–75 727 098, 70 bázis4. exon: 75 760 932–75 761 038, 107 bázis5. exon: 75 795 401–75 795 431, 31 bázis6. exon: 75 796 636–75 796 749, 114 bázis7. exon: 75 800 684–75 800 882, 199 bázis8. exon: 75 804 289–75 804 541, 253 bázis9. exon: 75 805 479–75 805 760, 282 bázis10. exon: 75 807 480–75 808 199, 720 bázis11. exon: 75 809 154–75 809 183, 30 bázis12. exon: 75 817 161–75 817 278, 118 bázis13. exon: 75 819 393–75 819 535, 143 bázis14. exon: 75 821 177–75 821 609, 433 bázis15. exon: 75 823 565–75 823 873, 309 bázis16. exon: 75 833 051–75 833 165, 115 bázis17. exon: 75 834 226–75 834 387, 162 bázis18. exon: 75 835 233–75 835 339, 107 bázis19. exon: 75 836 397–75 836 457, 61 bázis20. exon: 75 838 140–75 838 196, 57 bázis21. exon: 75 840 085–75 840 110, 26 bázis22. exon: 75 840 391–75 840 495, 105 bázis23. exon: 75 841 109–75 841 201, 93 bázis24. exon: 75 841 628–75 841 983, 356 bázis25. exon: 75 842 851–75 842 916, 66 bázis26. exon: 75 845 327–75 845 379, 53 bázis27. exon: 75 849 079–75 849 292, 214 bázis28. exon: 75 853 092–75 853 388, 297 bázis29. exon: 75 855 260–75 855 368, 109 bázis30. exon: 75 856 506–75 856 608, 103 bázis31. exon: 75 857 921–75 859 866, 1946 bázis120315′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 223,5 kb-jából 7,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4896 bázis kódolja a fehérjét.

LMO7 szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a LMO7 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

Almost all of LMO7's exons sit where short reads map cleanly.

What adds to it: the share of LMO7's exons in each kind of hard region

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések3%
  • GC-tartalom7,8%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scored

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LMO7 gén: LIM domain 7. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lmo7

Vancouver

Dante Labs. LMO7 gén: LIM domain 7 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lmo7

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet