Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SLC4A9

solute carrier family 4 member 9

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
5q31.3
Koordináták
5. kromoszóma: 140 360 194–140 375 141 (GRCh38)
Exonok
22 exon, összesen 14,9 kb
Fehérje
959 aminosav
Más néven ismert
AE4
MANE Select transzkriptum
ENST00000506757.7NM_031467.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SLC4A9 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SLC4A9 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
5. kromoszóma, a SLC4A9 helyét zárójel jelöli. A SLC4A9 és környékén 32 gén a 5. kromoszómán, 139 867 668–140 867 667 között.5. kromoszóma5q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3140 Mb140,2 Mb140,4 Mb140,6 Mb140,8 MbNRG2: 139 846 779–140 043 328, fordított szálNRG2PURA: 140 107 777–140 125 619, előre szálPURAIGIP: 140 125 937–140 129 392, előre szálIGIPCYSTM1: 140 174 924–140 282 212, előre szálCYSTM1PFDN1: 140 234 986–140 303 119, fordított szálPFDN1HBEGF: 140 332 843–140 346 614, fordított szálHBEGFSLC4A9: 140 360 194–140 375 141, előre szálSLC4A9ANKHD1: 140 401 660–140 541 168, előre szálANKHD1ANKHD1-EIF4EBP3: 140 401 908–140 549 569, előre szálANKHD1-EIF4EBP3SRA1: 140 536 450–140 557 920, fordított szálSRA1EIF4EBP3: 140 547 616–140 551 708, előre szálEIF4EBP3APBB3: 140 558 268–140 564 781, fordított szálSLC35A4: 140 564 440–140 569 215, előre szálSURMIR: 140 564 440–140 569 215, előre szálCD14: 140 630 402–140 633 711, fordított szálCD14NDUFA2: 140 638 740–140 647 823, fordított szálNDUFA2TMCO6: 140 639 396–140 647 730, előre szálTMCO6IK: 140 647 058–140 662 480, előre szálIKWDR55: 140 664 476–140 674 124, előre szálDND1: 140 670 794–140 673 576, fordított szálHARS1: 140 673 035–140 691 537, fordított szálHARS2: 140 691 422–140 699 315, előre szálHARS2ZMAT2: 140 698 680–140 707 729, előre szálPCDHA1: 140 786 136–141 012 351, előre szálPCDHA1PCDHA2: 140 794 845–141 012 351, előre szálPCDHA2PCDHA3: 140 801 018–141 012 351, előre szálPCDHA3PCDHA4: 140 807 037–141 012 347, előre szálPCDHA4PCDHA5: 140 821 599–141 012 347, előre szálPCDHA6: 140 827 958–141 012 351, előre szálPCDHA7: 140 834 231–141 012 351, előre szálPCDHA8: 140 841 185–141 012 351, előre szálPCDHA9: 140 847 772–141 012 351, előre szálPCDHA10: 140 855 883–141 012 351, előre szálA SLC4A9 ábrája: 22 exon a(z) 5. kromoszóma előre szálán1. exon: 140 360 194–140 360 466, 273 bázis2. exon: 140 360 812–140 360 972, 161 bázis3. exon: 140 361 254–140 361 367, 114 bázis4. exon: 140 361 808–140 361 863, 56 bázis5. exon: 140 362 017–140 362 174, 158 bázis6. exon: 140 362 445–140 362 532, 88 bázis7. exon: 140 362 912–140 363 066, 155 bázis8. exon: 140 363 439–140 363 555, 117 bázis9. exon: 140 363 728–140 363 902, 175 bázis10. exon: 140 364 054–140 364 187, 134 bázis11. exon: 140 364 363–140 364 625, 263 bázis12. exon: 140 365 520–140 365 578, 59 bázis13. exon: 140 365 834–140 366 022, 189 bázis14. exon: 140 366 151–140 366 264, 114 bázis15. exon: 140 367 420–140 367 581, 162 bázis16. exon: 140 367 720–140 367 898, 179 bázis17. exon: 140 368 587–140 368 659, 73 bázis18. exon: 140 371 095–140 371 163, 69 bázis19. exon: 140 371 451–140 371 624, 174 bázis20. exon: 140 372 242–140 372 397, 156 bázis21. exon: 140 372 745–140 372 843, 99 bázis22. exon: 140 374 827–140 375 141, 315 bázis12468101214161820225′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 14,9 kb-jából 3,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2880 bázis kódolja a fehérjét.

SLC4A9 szekvenálása

2Könnyű

Mennyire nehéz a SLC4A9 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A SLC4A9 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a SLC4A9 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések1,5%
  • GC-tartalom7,9%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC4A9 gén: solute carrier family 4 member 9. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/slc4a9

Vancouver

Dante Labs. SLC4A9 gén: solute carrier family 4 member 9 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/slc4a9

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet