Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SLC29A1

solute carrier family 29 member 1 (Augustine blood group)

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
6p21.1
Koordináták
6. kromoszóma: 44 223 595–44 234 142 (GRCh38)
Exonok
13 exon, összesen 10,5 kb
Fehérje
456 aminosav
Korábbi jelölések
ENT1
MANE Select transzkriptum
ENST00000371755.9NM_001372327.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SLC29A1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SLC29A1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
6. kromoszóma, a SLC29A1 helyét zárójel jelöli. A SLC29A1 és környékén 15 gén a 6. kromoszómán, 43 728 869–44 728 868 között.6. kromoszóma6p21.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2743,8 Mb44 Mb44,2 Mb44,4 Mb44,6 MbVEGFA: 43 770 184–43 786 487, előre szálVEGFALINC03040: 44 000 580–44 007 830, előre szálLINC03040MRPL14: 44 078 275–44 134 339, fordított szálMRPL14TMEM63B: 44 126 614–44 155 520, előre szálTMEM63BCAPN11: 44 158 811–44 184 401, előre szálCAPN11MYMX: 44 192 822–44 218 236, előre szálMYMXSLC29A1: 44 223 595–44 234 142, előre szálSLC29A1HSP90AB1: 44 237 395–44 253 888, előre szálHSP90AB1SLC35B2: 44 253 872–44 257 890, fordított szálSLC35B2NFKBIE: 44 258 166–44 265 788, fordított szálNFKBIETMEM151B: 44 270 450–44 307 506, előre szál: 44 273 194–44 378 957, előre szálDRC5: 44 278 718–44 297 725, fordított szálDRC5AARS2: 44 298 726–44 313 376, fordított szálSPATS1: 44 342 650–44 380 179, előre szálSPATS1CDC5L: 44 387 547–44 450 924, előre szálCDC5LA SLC29A1 ábrája: 13 exon a(z) 6. kromoszóma előre szálán1. exon: 44 223 595–44 223 641, 47 bázis2. exon: 44 227 263–44 227 342, 80 bázis3. exon: 44 229 390–44 229 471, 82 bázis4. exon: 44 229 589–44 229 791, 203 bázis5. exon: 44 229 907–44 230 046, 140 bázis6. exon: 44 230 347–44 230 481, 135 bázis7. exon: 44 230 568–44 230 665, 98 bázis8. exon: 44 230 811–44 230 889, 79 bázis9. exon: 44 231 364–44 231 461, 98 bázis10. exon: 44 231 998–44 232 106, 109 bázis11. exon: 44 232 343–44 232 428, 86 bázis12. exon: 44 232 807–44 233 006, 200 bázis13. exon: 44 233 417–44 234 142, 726 bázis123456789101112135′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 10,5 kb-jából 2,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1371 bázis kódolja a fehérjét.

SLC29A1 szekvenálása

4Könnyű

Mennyire nehéz a SLC29A1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A SLC29A1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a SLC29A1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,3%
  • GC-tartalom17%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC29A1 gén: solute carrier family 29 member 1 (Augustine blood group). Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/slc29a1

Vancouver

Dante Labs. SLC29A1 gén: solute carrier family 29 member 1 (Augustine blood group) [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/slc29a1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet