Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PTPN20

protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
10q11.22
Koordináták
10. kromoszóma: 46 911 428–47 002 322 (GRCh38)
Exonok
11 exon, összesen 90,9 kb
Fehérje
420 aminosav
Más néven ismert
bA42B19.1, DKFZP566K0524, bA142I17.1, CT126
Korábbi jelölések
PTPN20A, PTPN20B
MANE Select transzkriptum
ENST00000374339.5NM_001042357.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PTPN20 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PTPN20 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
10. kromoszóma, a PTPN20 helyét zárójel jelöli. A PTPN20 és környékén 7 gén a 10. kromoszómán, 46 456 875–47 456 874 között.10. kromoszóma10q11.22p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.346,6 Mb46,8 Mb47 Mb47,2 Mb47,4 MbNPY4R: 46 457 654–46 470 424, fordított szálNPY4RGPRIN2: 46 541 736–46 557 569, fordított szálGPRIN2SYT15: 46 578 217–46 597 107, előre szálSYT15PTPN20: 46 911 428–47 002 322, előre szálPTPN20GDF10: 47 300 060–47 313 580, előre szálGDF10GDF2: 47 322 451–47 327 592, előre szálGDF2RBP3: 47 348 363–47 357 881, előre szálRBP3ZNF488: 47 356 520–47 384 331, fordított szálZNF488A PTPN20 ábrája: 11 exon a(z) 10. kromoszóma előre szálán1. exon: 46 911 428–46 911 501, 74 bázis2. exon: 46 932 377–46 932 533, 157 bázis3. exon: 46 940 623–46 940 717, 95 bázis4. exon: 46 943 918–46 944 015, 98 bázis5. exon: 46 946 563–46 946 675, 113 bázis6. exon: 46 964 986–46 965 137, 152 bázis7. exon: 46 967 957–46 968 047, 91 bázis8. exon: 46 984 230–46 984 564, 335 bázis9. exon: 46 987 340–46 987 555, 216 bázis10. exon: 46 999 912–46 999 974, 63 bázis11. exon: 47 000 676–47 002 322, 1647 bázis1115′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 90,9 kb-jából 3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1263 bázis kódolja a fehérjét.

PTPN20 szekvenálása

30Magas

Mennyire nehéz a PTPN20 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

  • Leképezhetőség44%
  • Homológia44%
  • Ismétlődések1,2%
  • GC-tartalom13%
  • Referencia-lefedettség0%

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PTPN20 gén: protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ptpn20

Vancouver

Dante Labs. PTPN20 gén: protein tyrosine phosphatase non-receptor type 20 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ptpn20

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet