Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PLXDC1

plexin domain containing 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17q12
Koordináták
17. kromoszóma: 39 063 313–39 151 637 (GRCh38)
Exonok
14 exon, összesen 88,3 kb
Fehérje
500 aminosav
Más néven ismert
TEM3, TEM7
MANE Select transzkriptum
ENST00000315392.9NM_020405.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PLXDC1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PLXDC1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a PLXDC1 helyét zárójel jelöli. A PLXDC1 és környékén 20 gén a 17. kromoszómán, 38 607 475–39 607 474 között.17. kromoszóma17q12p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.338,8 Mb39 Mb39,2 Mb39,4 Mb39,6 MbEPOP: 38 671 703–38 674 957, fordított szálEPOPMLLT6: 38 705 244–38 729 799, előre szálMLLT6CISD3: 38 730 151–38 735 605, előre szálCISD3PCGF2: 38 733 065–38 752 555, fordított szálPCGF2PSMB3: 38 752 726–38 803 069, előre szálPSMB3PIP4K2B: 38 765 691–38 800 126, fordított szálPIP4K2BCWC25: 38 800 441–38 825 646, fordított szálCWC25SPMAP1: 38 835 086–38 841 438, fordított szálSPMAP1RPL23: 38 847 860–38 868 644, fordított szálRPL23LASP1: 38 869 185–38 921 771, előre szálLASP1LASP1NB: 38 925 565–38 929 381, előre szálLASP1NBFBXO47: 38 936 432–38 967 407, fordított szálFBXO47PLXDC1: 39 063 313–39 151 637, fordított szálPLXDC1ARL5C: 39 156 894–39 167 484, fordított szálARL5CCACNB1: 39 173 453–39 197 877, fordított szálCACNB1RPL19: 39 200 282–39 204 840, előre szálRPL19STAC2: 39 210 540–39 225 945, fordított szálSTAC2FBXL20: 39 252 663–39 402 523, fordított szálFBXL20MED1: 39 404 253–39 451 306, fordított szálMED1CDK12: 39 461 437–39 567 559, előre szálCDK12NEUROD2: 39 603 536–39 609 777, fordított szálNEUROD2A PLXDC1 ábrája: 14 exon a(z) 17. kromoszóma fordított szálán14. exon: 39 063 313–39 067 959, 4647 bázis13. exon: 39 069 856–39 070 016, 161 bázis12. exon: 39 072 450–39 072 485, 36 bázis11. exon: 39 077 913–39 078 048, 136 bázis10. exon: 39 079 104–39 079 164, 61 bázis9. exon: 39 083 459–39 083 540, 82 bázis8. exon: 39 087 607–39 087 702, 96 bázis7. exon: 39 105 854–39 105 953, 100 bázis6. exon: 39 107 407–39 107 525, 119 bázis5. exon: 39 108 123–39 108 245, 123 bázis4. exon: 39 108 904–39 108 973, 70 bázis3. exon: 39 109 248–39 109 391, 144 bázis2. exon: 39 139 654–39 139 832, 179 bázis1. exon: 39 151 362–39 151 637, 276 bázis141210864215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 88,3 kb-jából 6,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1503 bázis kódolja a fehérjét.

PLXDC1 szekvenálása

2Könnyű

Mennyire nehéz a PLXDC1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A PLXDC1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a PLXDC1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,1%
  • GC-tartalom8,4%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PLXDC1 gén: plexin domain containing 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/plxdc1

Vancouver

Dante Labs. PLXDC1 gén: plexin domain containing 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/plxdc1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet