Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LASP1

LIM and SH3 protein 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17q12
Koordináták
17. kromoszóma: 38 870 058–38 921 770 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 51,7 kb
Fehérje
261 aminosav
Más néven ismert
MLN50, Lasp-1
MANE Select transzkriptum
ENST00000318008.11NM_006148.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LASP1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LASP1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a LASP1 helyét zárójel jelöli. A LASP1 és környékén 20 gén a 17. kromoszómán, 38 395 914–39 395 913 között.17. kromoszóma17q12p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.338,4 Mb38,6 Mb38,8 Mb39 Mb39,2 MbSOCS7: 38 351 844–38 405 593, előre szálSOCS7ARHGAP23: 38 419 260–38 512 385, előre szálARHGAP23SRCIN1: 38 530 031–38 605 952, fordított szálSRCIN1EPOP: 38 671 703–38 674 957, fordított szálEPOPMLLT6: 38 705 244–38 729 799, előre szálMLLT6CISD3: 38 730 151–38 735 605, előre szálCISD3PCGF2: 38 733 065–38 752 555, fordított szálPCGF2PSMB3: 38 752 726–38 803 069, előre szálPSMB3PIP4K2B: 38 765 691–38 800 126, fordított szálPIP4K2BCWC25: 38 800 441–38 825 646, fordított szálCWC25SPMAP1: 38 835 086–38 841 438, fordított szálSPMAP1RPL23: 38 847 860–38 868 644, fordított szálRPL23LASP1: 38 870 058–38 921 770, előre szálLASP1LASP1NB: 38 925 565–38 929 381, előre szálLASP1NBFBXO47: 38 936 432–38 967 407, fordított szálFBXO47PLXDC1: 39 063 313–39 154 394, fordított szálPLXDC1ARL5C: 39 156 894–39 167 484, fordított szálARL5CCACNB1: 39 173 453–39 197 877, fordított szálCACNB1RPL19: 39 200 282–39 204 840, előre szálRPL19STAC2: 39 210 540–39 225 945, fordított szálSTAC2FBXL20: 39 252 663–39 402 523, fordított szálFBXL20A LASP1 ábrája: 7 exon a(z) 17. kromoszóma előre szálán1. exon: 38 870 058–38 870 258, 201 bázis2. exon: 38 878 086–38 878 180, 95 bázis3. exon: 38 890 420–38 890 504, 85 bázis4. exon: 38 898 412–38 898 519, 108 bázis5. exon: 38 914 325–38 914 475, 151 bázis6. exon: 38 915 043–38 915 146, 104 bázis7. exon: 38 918 605–38 921 770, 3166 bázis124675′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 51,7 kb-jából 3,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 786 bázis kódolja a fehérjét.

LASP1 szekvenálása

14Közepes

Mennyire nehéz a LASP1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

  • Leképezhetőség0,4%
  • Homológia40%
  • Ismétlődések1,9%
  • GC-tartalom12%
  • Referencia-lefedettség0%

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LASP1 gén: LIM and SH3 protein 1. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lasp1

Vancouver

Dante Labs. LASP1 gén: LIM and SH3 protein 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lasp1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet