Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

NPIPB11

nuclear pore complex interacting protein family member B11

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
16p11.2
Koordináták
16. kromoszóma: 29 381 310–29 406 711 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 25,4 kb
Fehérje
1161 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000698511.1NM_001310137.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) NPIPB11 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A NPIPB11 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
16. kromoszóma, a NPIPB11 helyét zárójel jelöli. A NPIPB11 és környékén 24 gén a 16. kromoszómán, 28 894 011–29 894 010 között.16. kromoszóma16p11.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.329 Mb29,2 Mb29,4 Mb29,6 Mb29,8 MbATP2A1: 28 878 383–28 904 511, előre szálATP2A1RABEP2: 28 898 740–28 936 526, fordított szálRABEP2CD19: 28 931 965–28 939 342, előre szálCD19NFATC2IP: 28 950 807–28 967 092, előre szálNFATC2IPSPNS1: 28 974 126–28 984 548, előre szálSPNS1LAT: 28 984 808–28 990 784, előre szálLATNPIPB11: 29 381 310–29 406 711, fordított szálNPIPB11BOLA2-SMG1P6: 29 443 230–29 454 651, fordított szálBOLA2-SMG1P6BOLA2: 29 453 587–29 455 012, fordított szálBOLA2SLX1B: 29 454 501–29 458 223, előre szálSLX1BSULT1A4: 29 458 993–29 464 979, előre szálSULT1A4NPIPB12: 29 483 534–29 508 595, fordított szálSPN: 29 662 957–29 670 876, előre szálSPNQPRT: 29 662 957–29 698 704, előre szálQPRTC16orf54: 29 742 463–29 746 079, fordított szálC16orf54ZG16: 29 760 591–29 783 885, előre szálZG16KIF22: 29 790 137–29 805 388, előre szálKIF22MAZ: 29 805 637–29 811 176, előre szálMAZPRRT2: 29 811 382–29 815 892, előre szálPRRT2: 29 812 261–29 820 092, előre szálPAGR1: 29 816 086–29 822 489, előre szál: 29 817 239–29 830 627, előre szálMVP: 29 820 394–29 848 039, előre szálCDIPT: 29 857 474–29 863 414, fordított szálCDIPTSEZ6L2: 29 871 159–29 899 582, fordított szálSEZ6L2A NPIPB11 ábrája: 8 exon a(z) 16. kromoszóma fordított szálán8. exon: 29 381 310–29 384 289, 2980 bázis7. exon: 29 385 650–29 385 685, 36 bázis6. exon: 29 385 795–29 385 855, 61 bázis5. exon: 29 389 941–29 390 136, 196 bázis4. exon: 29 390 249–29 390 348, 100 bázis3. exon: 29 393 948–29 394 076, 129 bázis2. exon: 29 403 683–29 403 840, 158 bázis1. exon: 29 404 003–29 406 711, 2709 bázis864215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 25,4 kb-jából 6,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3486 bázis kódolja a fehérjét.

NPIPB11 szekvenálása

98Nehéz

Mennyire nehéz a NPIPB11 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A NPIPB11 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a NPIPB11 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség94%
  • Homológia100%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések44%
  • GC-tartalom0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). NPIPB11 gén: nuclear pore complex interacting protein family member B11. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/npipb11

Vancouver

Dante Labs. NPIPB11 gén: nuclear pore complex interacting protein family member B11 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/npipb11

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet