Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LRIT1

leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
10q23.1
Koordináták
10. kromoszóma: 84 231 520–84 241 546 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 10 kb
Fehérje
623 aminosav
Más néven ismert
PAL, DKFZP434K091, FIGLER9
Korábbi jelölések
LRRC21
MANE Select transzkriptum
ENST00000372105.4NM_015613.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LRIT1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LRIT1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
10. kromoszóma, a LRIT1 helyét zárójel jelöli. A LRIT1 és környékén 6 gén a 10. kromoszómán, 83 736 533–84 736 532 között.10. kromoszóma10q23.1p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.383,8 Mb84 Mb84,2 Mb84,4 Mb84,6 MbGHITM: 84 139 482–84 154 841, előre szálGHITMGPR15LG: 84 173 759–84 185 294, előre szálGPR15LGCDHR1: 84 194 514–84 221 689, előre szálCDHR1LRIT2: 84 220 571–84 225 544, fordított szálLRIT2RGR: 84 230 666–84 260 637, előre szálRGRLRIT1: 84 231 520–84 241 546, fordított szálLRIT1CCSER2: 84 328 542–84 518 521, előre szálCCSER2A LRIT1 ábrája: 4 exon a(z) 10. kromoszóma fordított szálán4. exon: 84 231 520–84 232 903, 1384 bázis3. exon: 84 234 073–84 234 378, 306 bázis2. exon: 84 237 220–84 237 686, 467 bázis1. exon: 84 241 318–84 241 546, 229 bázis43215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 10 kb-jából 2,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1872 bázis kódolja a fehérjét.

LRIT1 szekvenálása

3Alacsony

Mennyire nehéz a LRIT1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések3,4%
  • GC-tartalom26%
  • Referencia-lefedettség0%

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LRIT1 gén: leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 1. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lrit1

Vancouver

Dante Labs. LRIT1 gén: leucine rich repeat, Ig-like and transmembrane domains 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lrit1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet