Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

GATAD2A

GATA zinc finger domain containing 2A

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19p13.11
Koordináták
19. kromoszóma: 19 405 675–19 508 932 (GRCh38)
Exonok
12 exon, összesen 103,3 kb
Fehérje
634 aminosav
Más néven ismert
p66alpha
MANE Select transzkriptum
ENST00000683918.1NM_001384528.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) GATAD2A gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A GATAD2A felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a GATAD2A helyét zárójel jelöli. A GATAD2A és környékén 28 gén a 19. kromoszómán, 18 957 304–19 957 303 között.19. kromoszóma19p13.11p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4319 Mb19,2 Mb19,4 Mb19,6 Mb19,8 MbSUGP2: 18 990 887–19 061 647, fordított szálSUGP2ARMC6: 19 033 575–19 060 311, előre szálARMC6SLC25A42: 19 061 697–19 113 030, előre szálSLC25A42TMEM161A: 19 119 148–19 138 513, fordított szálMEF2B: 19 145 563–19 192 589, fordított szálMEF2BBORCS8-MEF2B: 19 145 569–19 192 158, fordított szálBORCS8: 19 163 148–19 192 591, fordított szálBORCS8RFXANK: 19 191 957–19 202 844, előre szálRFXANKNR2C2AP: 19 201 409–19 203 729, fordított szálNR2C2APNCAN: 19 211 948–19 252 247, előre szálNCANHAPLN4: 19 254 731–19 262 827, fordított szálHAPLN4TM6SF2: 19 263 385–19 273 406, fordított szálTM6SF2SUGP1: 19 276 018–19 320 511, fordított szálSUGP1MAU2: 19 320 811–19 358 754, előre szálMAU2GATAD2A: 19 405 675–19 508 932, előre szálGATAD2ATSSK6: 19 512 396–19 515 553, fordított szálTSSK6NDUFA13: 19 515 728–19 529 054, előre szálNDUFA13: 19 516 227–19 536 076, előre szálYJEFN3: 19 528 851–19 537 584, előre szálCILP2: 19 538 248–19 546 659, előre szálPBX4: 19 561 707–19 618 746, fordított szálPBX4LPAR2: 19 623 639–19 628 930, fordított szálLPAR2GMIP: 19 629 473–19 643 669, fordított szálGMIPATP13A1: 19 645 196–19 663 700, fordított szálATP13A1ZNF101: 19 668 781–19 683 509, előre szálZNF101ZNF14: 19 708 130–19 733 119, fordított szálZNF14ZNF506: 19 761 038–19 821 784, fordított szálZNF506ZNF253: 19 865 812–19 897 770, előre szálZNF253ZNF93: 19 900 888–19 963 464, előre szálZNF93A GATAD2A ábrája: 12 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 19 405 675–19 406 019, 345 bázis2. exon: 19 465 340–19 465 614, 275 bázis3. exon: 19 492 306–19 492 438, 133 bázis4. exon: 19 492 581–19 492 712, 132 bázis5. exon: 19 494 294–19 494 383, 90 bázis6. exon: 19 495 754–19 495 885, 132 bázis7. exon: 19 496 052–19 496 219, 168 bázis8. exon: 19 498 443–19 498 722, 280 bázis9. exon: 19 501 118–19 501 416, 299 bázis10. exon: 19 501 969–19 502 043, 75 bázis11. exon: 19 502 331–19 502 526, 196 bázis12. exon: 19 505 344–19 508 932, 3589 bázis1246810125′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 103,3 kb-jából 5,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1905 bázis kódolja a fehérjét.

GATAD2A szekvenálása

7Könnyű

Mennyire nehéz a GATAD2A rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A GATAD2A exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a GATAD2A exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések7,5%
  • GC-tartalom25%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). GATAD2A gén: GATA zinc finger domain containing 2A. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/gatad2a

Vancouver

Dante Labs. GATAD2A gén: GATA zinc finger domain containing 2A [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/gatad2a

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet