Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

EIF2S2

eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
20q11.22
Koordináták
20. kromoszóma: 34 088 309–34 112 243 (GRCh38)
Exonok
9 exon, összesen 23,9 kb
Fehérje
333 aminosav
Más néven ismert
EIF2beta, PPP1R67
Korábbi jelölések
EIF2
MANE Select transzkriptum
ENST00000374980.3NM_003908.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) EIF2S2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A EIF2S2 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
20. kromoszóma, a EIF2S2 helyét zárójel jelöli. A EIF2S2 és környékén 16 gén a 20. kromoszómán, 33 600 276–34 600 275 között.20. kromoszóma20q11.22p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3333,8 Mb34 Mb34,2 Mb34,4 Mb34,6 MbCBFA2T2: 33 490 060–33 650 036, előre szálNECAB3: 33 657 087–33 674 473, fordított szálNECAB3C20orf144: 33 662 327–33 665 619, előre szálACTL10: 33 666 943–33 668 525, előre szálACTL10E2F1: 33 675 477–33 686 426, fordított szálE2F1PXMP4: 33 702 758–33 720 412, fordított szálPXMP4ZNF341: 33 731 657–33 792 269, előre szálZNF341CHMP4B: 33 811 253–33 854 366, előre szálCHMP4BRALY: 33 993 632–34 108 308, előre szálRALYEIF2S2: 34 088 309–34 112 243, fordított szálEIF2S2ASIP: 34 194 569–34 269 346, előre szálASIPAHCY: 34 280 263–34 311 802, fordított szálAHCYITCH: 34 363 235–34 511 773, előre szálITCH: 34 363 271–34 540 923, előre szálDYNLRB1: 34 515 600–34 540 958, előre szálDYNLRB1MAP1LC3A: 34 546 838–34 560 357, előre szálMAP1LC3APIGU: 34 560 542–34 698 790, fordított szálPIGUA EIF2S2 ábrája: 9 exon a(z) 20. kromoszóma fordított szálán9. exon: 34 088 309–34 089 905, 1597 bázis8. exon: 34 090 517–34 090 602, 86 bázis7. exon: 34 093 675–34 093 731, 57 bázis6. exon: 34 096 657–34 096 805, 149 bázis5. exon: 34 097 416–34 097 516, 101 bázis4. exon: 34 098 498–34 098 633, 136 bázis3. exon: 34 103 462–34 103 565, 104 bázis2. exon: 34 105 368–34 105 545, 178 bázis1. exon: 34 112 096–34 112 243, 148 bázis9876543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 23,9 kb-jából 2,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1002 bázis kódolja a fehérjét.

EIF2S2 szekvenálása

17Közepes

Mennyire nehéz a EIF2S2 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A EIF2S2 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ami tovább nehezíti: a EIF2S2 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség15%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,7%
  • GC-tartalom5,8%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). EIF2S2 gén: eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/eif2s2

Vancouver

Dante Labs. EIF2S2 gén: eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/eif2s2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet