Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

CT45A10

cancer/testis antigen family 45 member A10

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
Xq26.3
Koordináták
X. kromoszóma: 135 881 065–135 893 444 (GRCh38)
Exonok
5 exon, összesen 12,4 kb
Fehérje
189 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000682849.1NM_001291529.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CT45A10 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A CT45A10 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
X. kromoszóma, a CT45A10 helyét zárójel jelöli. A CT45A10 és környékén 17 gén a X. kromoszómán, 135 387 255–136 387 254 között.X. kromoszómaXq26.3p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q28135,4 Mb135,6 Mb135,8 Mb136 Mb136,2 Mb: 135 391 849–135 392 207, fordított szálSMIM10L2A: 135 421 939–135 428 504, előre szálSMIM10L2AINTS6L: 135 520 616–135 582 534, előre szálINTS6LCT45A1: 135 708 083–135 723 539, előre szálCT45A1CT45A3: 135 759 846–135 768 191, fordított szálCT45A3CT45A5: 135 775 852–135 785 503, fordított szálCT45A5CT45A6: 135 794 685–135 802 787, fordított szálCT45A6CT45A2: 135 811 668–135 820 012, fordított szálCT45A2CT45A7: 135 829 229–135 837 280, fordított szálCT45A7CT45A8: 135 846 476–135 854 586, fordított szálCT45A8CT45A9: 135 863 418–135 871 875, fordított szálCT45A9CT45A10: 135 881 065–135 893 444, fordított szálCT45A10SAGE1: 135 890 182–135 913 062, előre szálSAGE1MMGT1: 135 960 588–135 974 068, fordított szálMMGT1SLC9A6: 135 973 841–136 047 269, előre szálSLC9A6FHL1: 136 146 702–136 211 359, előre szálFHL1MAP7D3: 136 213 220–136 256 482, fordított szálMAP7D3ADGRG4: 136 300 963–136 416 890, előre szálADGRG4A CT45A10 ábrája: 5 exon a(z) X. kromoszóma fordított szálán5. exon: 135 881 065–135 881 315, 251 bázis4. exon: 135 882 536–135 882 629, 94 bázis3. exon: 135 883 008–135 883 256, 249 bázis2. exon: 135 885 176–135 885 350, 175 bázis1. exon: 135 893 345–135 893 444, 100 bázis543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 12,4 kb-jából 0,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 570 bázis kódolja a fehérjét.

CT45A10 szekvenálása

54Nehéz

Mennyire nehéz a CT45A10 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-as skálán

A CT45A10 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a CT45A10 exonjainak aránya az egyes nehéz régiótípusokban

  • Leképezhetőség79%
  • Homológia88%
  • Ismétlődések0%
  • GC-tartalom0%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle nehezen szekvenálható régiókat bemutató térképeire épül.Hogyan számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). CT45A10 gén: cancer/testis antigen family 45 member A10. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ct45a10

Vancouver

Dante Labs. CT45A10 gén: cancer/testis antigen family 45 member A10 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ct45a10

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet