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Gène

TSPAN1

tetraspanin 1

Résumé

Localisation cytogénétique
1p34.1
Coordonnées
Chromosome 1 : 46 175 087–46 185 962 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 10,9 kb
Protéine
241 acides aminés
Aussi appelé
TSPAN-1, NET-1
Transcrit MANE Select
ENST00000372003.6NM_005727.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TSPAN1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TSPAN1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de TSPAN1. TSPAN1 et 22 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 45 680 525 à 46 680 524.Chromosome 11p34.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4445,8 Mb46 Mb46,2 Mb46,4 Mb46,6 MbGPBP1L1 : 45 627 284–45 688 408, brin inverseGPBP1L1TMEM69 : 45 688 149–45 718 150, brin directTMEM69KLHL27 : 45 692 370–45 750 805, brin inverseKLHL27MAST2 : 45 786 987–46 036 228, brin directMAST2PIK3R3 : 46 040 140–46 133 346, brin inversePIK3R3P3R3URF-PIK3R3 : 46 043 661–46 176 488, brin inverseP3R3URF-PIK3R3P3R3URF : 46 171 017–46 176 488, brin inverseP3R3URFTSPAN1 : 46 175 087–46 185 962, brin directTSPAN1POMGNT1 : 46 188 681–46 220 305, brin inversePOMGNT1LURAP1 : 46 203 191–46 223 718, brin directLURAP1RAD54L : 46 246 461–46 282 459, brin directRAD54LLRRC41 : 46 261 195–46 303 630, brin inverseLRRC41UQCRH : 46 300 900–46 334 910, brin directUQCRHNSUN4 : 46 340 691–46 369 218, brin directNSUN4FAAH : 46 394 265–46 415 754, brin directFAAHDMBX1 : 46 489 822–46 516 218, brin directDMBX1TMEM275 : 46 532 166–46 544 566, brin inverseTMEM275KNCN : 46 545 641–46 551 647, brin inverseKNCNMKNK1 : 46 557 407–46 616 850, brin inverseMKNK1MOB3C : 46 607 707–46 616 889, brin inverseMOB3CATPAF1 : 46 632 071–46 673 867, brin inverseATPAF1TEX38 : 46 668 855–46 673 595, brin directTEX38EFCAB14 : 46 674 659–46 719 146, brin inverseEFCAB14Schéma de TSPAN1 : 9 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 46 175 087–46 175 409, 323 basesExon 2 : 46 180 526–46 180 658, 133 basesExon 3 : 46 181 100–46 181 164, 65 basesExon 4 : 46 184 191–46 184 397, 207 basesExon 5 : 46 184 594–46 184 668, 75 basesExon 6 : 46 184 785–46 184 883, 99 basesExon 7 : 46 184 960–46 185 115, 156 basesExon 8 : 46 185 225–46 185 308, 84 basesExon 9 : 46 185 486–46 185 962, 477 bases1234567895′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,6 kb sur les 10,9 kb du gène ; 726 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit TSPAN1

1

position dans TSPAN1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 10,9 kb de TSPAN1, introns compris, et pas seulement les 1,6 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène TSPAN1 : tetraspanin 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tspan1

Vancouver

Dante Labs. Gène TSPAN1 : tetraspanin 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tspan1

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