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Gène

TRIM5

tripartite motif containing 5

Résumé

Localisation cytogénétique
11p15.4
Coordonnées
Chromosome 11 : 5 663 195–5 685 074 (GRCh38)
Exons
8 exons sur 21,9 kb
Protéine
493 acides aminés
Aussi appelé
RNF88, TRIM5alpha
Transcrit MANE Select
ENST00000380034.8NM_033034.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TRIM5. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TRIM5

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de TRIM5. TRIM5 et 43 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 5 174 135 à 6 174 134.Chromosome 1111p15.4p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q255,2 Mb5,4 Mb5,6 Mb5,8 Mb6 MbOR51V1 : 5 199 735–5 200 682, brin inverseOR51V1HBB : 5 225 464–5 229 395, brin inverseHBBHBD : 5 232 678–5 243 698, brin inverseHBDHBG1 : 5 248 204–5 249 859, brin inverse : 5 248 270–5 254 783, brin inverseHBG2 : 5 253 188–5 505 605, brin inverse : 5 254 392–5 678 434, brin inverseHBE1 : 5 268 345–5 505 652, brin inverseOR51B4 : 5 301 014–5 301 946, brin inverseOR51B5 : 5 303 444–5 505 652, brin inverseOR51B2 : 5 323 359–5 324 297, brin inverseOR51B6 : 5 351 508–5 352 446, brin directOR51M1 : 5 383 812–5 393 263, brin directOR51Q1 : 5 422 111–5 423 206, brin directOR51Q1OR51I1 : 5 440 570–5 441 514, brin inverseOR51I1OR51I2 : 5 449 323–5 456 518, brin directOR51I2OR52D1 : 5 488 685–5 489 749, brin directOR52D1UBQLN3 : 5 507 300–5 509 958, brin inverseUBQLN3UBQLNL : 5 514 393–5 518 431, brin inverseUBQLNLOR52H1 : 5 544 489–5 548 540, brin inverseOR52H1OR52B6 : 5 580 877–5 581 884, brin directOR52B6TRIM6 : 5 596 109–5 612 958, brin directTRIM6TRIM6-TRIM34 : 5 596 725–5 644 398, brin directTRIM6-TRIM34TRIM34 : 5 619 764–5 644 398, brin directTRIM34TRIM5 : 5 663 195–5 685 074, brin inverseTRIM5TRIM22 : 5 689 610–5 737 089, brin directTRIM22OR52P1 : 5 726 502–5 727 464, brin directOR52P1OR56B1 : 5 736 448–5 738 523, brin directOR56B1OR52N4 : 5 754 243–5 755 958, brin directOR52N4OR56B2 : 5 761 153–5 769 080, brin directOR52N5 : 5 776 165–5 783 355, brin inverseOR52N1 : 5 786 471–5 791 265, brin inverseOR52N1OR52N2 : 5 808 911–5 821 492, brin directOR52N2OR52E6 : 5 840 928–5 841 952, brin inverseOR52E6OR52E8 : 5 856 749–5 857 690, brin inverseOR52E8OR52E4 : 5 880 629–5 887 079, brin directOR52E4OR52E5 : 5 893 208–5 902 730, brin directOR52E5OR56A3 : 5 938 751–5 951 347, brin directOR56A3OR56A5 : 5 967 553–5 968 494, brin inverseOR56A5OR52L1 : 5 985 892–5 986 985, brin inverseOR52L1OR56A4 : 5 999 445–6 006 946, brin inverseOR56A4OR56A1 : 6 019 336–6 034 338, brin inverseOR56A1OR56B4 : 6 107 684–6 108 835, brin directOR56B4OR52B2 : 6 169 355–6 170 326, brin inverseOR52B2Schéma de TRIM5 : 8 exons sur le brin inverse du chromosome 11Exon 8 : 5 663 195–5 665 395, 2 201 basesExon 7 : 5 665 656–5 665 682, 27 basesExon 6 : 5 665 981–5 666 081, 101 basesExon 5 : 5 667 689–5 667 711, 23 basesExon 4 : 5 678 204–5 678 434, 231 basesExon 3 : 5 679 074–5 679 169, 96 basesExon 2 : 5 679 761–5 680 238, 478 basesExon 1 : 5 684 868–5 685 074, 207 bases876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,4 kb sur les 21,9 kb du gène ; 1 482 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène TRIM5 : tripartite motif containing 5. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trim5

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Dante Labs. Gène TRIM5 : tripartite motif containing 5 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trim5

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