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Gène

TPRG1

tumor protein p63 regulated 1

Résumé

Localisation cytogénétique
3q28
Coordonnées
Chromosome 3 : 189 171 971–189 325 304 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 153,3 kb
Protéine
275 acides aminés
Aussi appelé
FLJ41238, FLJ43694
Symboles précédents
FAM79B
Transcrit MANE Select
ENST00000345063.8NM_198485.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TPRG1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TPRG1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de TPRG1. TPRG1 et 2 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 188 748 638 à 189 748 637.Chromosome 33q28p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29188,8 Mb189 Mb189,2 Mb189,4 Mb189,6 MbLPP : 188 152 974–188 890 671, brin directLPPTPRG1 : 189 171 971–189 325 304, brin directTPRG1TP63 : 189 631 252–189 897 276, brin directTP63Schéma de TPRG1 : 6 exons sur le brin direct du chromosome 3Exon 1 : 189 171 971–189 172 131, 161 basesExon 2 : 189 207 376–189 207 594, 219 basesExon 3 : 189 215 292–189 215 383, 92 basesExon 4 : 189 238 733–189 238 909, 177 basesExon 5 : 189 310 386–189 310 539, 154 basesExon 6 : 189 320 626–189 325 304, 4 679 bases1234565′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,5 kb sur les 153,3 kb du gène ; 828 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de TPRG1

1Faible

Difficulté de séquençage de TPRG1 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions3,8 %
  • Teneur en GC0 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TPRG1 : tumor protein p63 regulated 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tprg1

Vancouver

Dante Labs. Gène TPRG1 : tumor protein p63 regulated 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tprg1

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