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Gène

SPTLC3

serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3

Résumé

Localisation cytogénétique
20p12.1
Coordonnées
Chromosome 20 : 13 008 972–13 169 103 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 160,1 kb
Protéine
552 acides aminés
Aussi appelé
LCB2B, FLJ11112, hLCB2b
Symboles précédents
C20orf38, SPTLC2L
Transcrit MANE Select
ENST00000399002.7NM_018327.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SPTLC3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SPTLC3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de SPTLC3. SPTLC3 et 2 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 12 589 038 à 13 589 037.Chromosome 2020p12.1p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3312,6 Mb12,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 MbSPTLC3 : 13 008 972–13 169 103, brin directSPTLC3ISM1 : 13 221 258–13 300 651, brin directISM1TASP1 : 13 387 216–13 639 109, brin inverseTASP1Schéma de SPTLC3 : 12 exons sur le brin direct du chromosome 20Exon 1 : 13 008 972–13 009 384, 413 basesExon 2 : 13 048 945–13 049 130, 186 basesExon 3 : 13 072 256–13 072 410, 155 basesExon 4 : 13 074 349–13 074 497, 149 basesExon 5 : 13 091 083–13 091 207, 125 basesExon 6 : 13 093 484–13 093 577, 94 basesExon 7 : 13 110 112–13 110 217, 106 basesExon 8 : 13 117 506–13 117 725, 220 basesExon 9 : 13 126 591–13 126 717, 127 basesExon 10 : 13 154 003–13 154 138, 136 basesExon 11 : 13 160 003–13 160 132, 130 basesExon 12 : 13 164 754–13 169 103, 4 350 bases1246810125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6,2 kb sur les 160,1 kb du gène ; 1 659 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SPTLC3 : serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sptlc3

Vancouver

Dante Labs. Gène SPTLC3 : serine palmitoyltransferase long chain base subunit 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sptlc3

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