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Gène

SPHKAP

SPHK1 interactor, AKAP domain containing

Résumé

Localisation cytogénétique
2q36.3
Coordonnées
Chromosome 2 : 227 979 955–228 181 687 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 201,7 kb
Protéine
1 700 acides aminés
Aussi appelé
SKIP
Transcrit MANE Select
ENST00000392056.8NM_001142644.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SPHKAP. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SPHKAP

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de SPHKAP. SPHKAP et 11 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 227 580 821 à 228 580 820.Chromosome 22q36.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3227,6 Mb227,8 Mb228 Mb228,2 Mb228,4 MbSCYGR2 : 227 598 893–227 599 255, brin directSCYGR2SCYGR10 : 227 608 784–227 609 101, brin directSCYGR10SCYGR3 : 227 614 538–227 614 840, brin inverseSCYGR3SCYGR4 : 227 617 498–227 617 815, brin directSCYGR4SCYGR5 : 227 666 804–227 667 061, brin directSCYGR5SLC19A3 : 227 683 763–227 718 088, brin inverseSLC19A3SCYGR6 : 227 724 440–227 724 757, brin inverseSCYGR6SCYGR7 : 227 728 335–227 728 625, brin directSCYGR7SCYGR8 : 227 745 894–227 746 220, brin directSCYGR8CCL20 : 227 805 739–227 817 564, brin directCCL20DAW1 : 227 870 931–227 924 344, brin directDAW1SPHKAP : 227 979 955–228 181 687, brin inverseSPHKAPSchéma de SPHKAP : 12 exons sur le brin inverse du chromosome 2Exon 12 : 227 979 955–227 981 860, 1 906 basesExon 11 : 227 991 000–227 991 184, 185 basesExon 10 : 227 991 274–227 991 326, 53 basesExon 9 : 227 993 534–227 993 620, 87 basesExon 8 : 227 995 509–227 995 694, 186 basesExon 7 : 228 016 406–228 020 156, 3 751 basesExon 6 : 228 021 711–228 021 966, 256 basesExon 5 : 228 025 394–228 025 528, 135 basesExon 4 : 228 027 484–228 027 543, 60 basesExon 3 : 228 108 832–228 108 939, 108 basesExon 2 : 228 131 980–228 132 085, 106 basesExon 1 : 228 181 567–228 181 687, 121 bases1210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7 kb sur les 201,7 kb du gène ; 5 103 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SPHKAP : SPHK1 interactor, AKAP domain containing. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sphkap

Vancouver

Dante Labs. Gène SPHKAP : SPHK1 interactor, AKAP domain containing [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sphkap

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