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Gène

SPATA21

spermatogenesis associated 21

Résumé

Localisation cytogénétique
1p36.13
Coordonnées
Chromosome 1 : 16 398 643–16 437 424 (GRCh38)
Exons
13 exons sur 38,8 kb
Protéine
469 acides aminés
Aussi appelé
spergen-2, spergen2
Transcrit MANE Select
ENST00000335496.5NM_198546.1
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SPATA21. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SPATA21

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de SPATA21. SPATA21 et 15 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 15 918 034 à 16 918 033.Chromosome 11p36.13p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4416 Mb16,2 Mb16,4 Mb16,6 Mb16,8 MbSPEN : 15 836 095–15 940 456, brin directSPENZBTB17 : 15 940 148–15 976 132, brin inverseZBTB17SRARP : 16 004 229–16 009 382, brin directHSPB7 : 16 014 018–16 020 597, brin inverseHSPB7CLCNKA : 16 018 146–16 034 109, brin directCLCNKACLCNKB : 16 040 252–16 057 367, brin directCLCNKBFAM131C : 16 057 769–16 073 664, brin inverseFAM131CEPHA2 : 16 124 337–16 156 141, brin inverseEPHA2ARHGEF19 : 16 197 854–16 212 893, brin inverseARHGEF19CPLANE2 : 16 231 692–16 237 214, brin inverseCPLANE2FBXO42 : 16 246 840–16 352 494, brin inverseFBXO42SZRD1 : 16 352 575–16 398 147, brin directSZRD1SPATA21 : 16 398 643–16 437 424, brin inverseSPATA21NECAP2 : 16 440 664–16 460 092, brin directNECAP2NBPF1 : 16 562 319–16 613 562, brin inverseNBPF1CROCC : 16 740 273–16 972 964, brin directCROCCSchéma de SPATA21 : 13 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 13 : 16 398 643–16 398 822, 180 basesExon 12 : 16 399 344–16 399 521, 178 basesExon 11 : 16 400 720–16 400 892, 173 basesExon 10 : 16 403 727–16 403 844, 118 basesExon 9 : 16 403 968–16 404 039, 72 basesExon 8 : 16 404 967–16 405 104, 138 basesExon 7 : 16 409 118–16 409 203, 86 basesExon 6 : 16 409 601–16 410 043, 443 basesExon 5 : 16 421 509–16 421 557, 49 basesExon 4 : 16 421 911–16 421 971, 61 basesExon 3 : 16 431 338–16 431 422, 85 basesExon 2 : 16 432 790–16 432 924, 135 basesExon 1 : 16 437 128–16 437 424, 297 bases1310515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2 kb sur les 38,8 kb du gène ; 1 410 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SPATA21 : spermatogenesis associated 21. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/spata21

Vancouver

Dante Labs. Gène SPATA21 : spermatogenesis associated 21 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/spata21

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