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Gène

SHPRH

SNF2 histone linker PHD RING helicase

Résumé

Localisation cytogénétique
6q24.3
Coordonnées
Chromosome 6 : 145 884 807–145 964 358 (GRCh38)
Exons
30 exons sur 79,6 kb
Protéine
1 683 acides aminés
Aussi appelé
FLJ90837, KIAA2023, bA545I5.2
Transcrit MANE Select
ENST00000275233.12NM_001042683.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SHPRH. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SHPRH

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de SHPRH. SHPRH et 3 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 145 424 583 à 146 424 582.Chromosome 66q24.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27145,6 Mb145,8 Mb146 Mb146,2 Mb146,4 MbEPM2A : 145 382 535–145 736 023, brin inverseEPM2AFBXO30 : 145 793 502–145 815 267, brin inverseFBXO30SHPRH : 145 884 807–145 964 358, brin inverseSHPRHGRM1 : 146 027 646–146 437 601, brin directGRM1Schéma de SHPRH : 30 exons sur le brin inverse du chromosome 6Exon 30 : 145 884 807–145 886 787, 1 981 basesExon 29 : 145 888 020–145 888 100, 81 basesExon 28 : 145 893 215–145 893 393, 179 basesExon 27 : 145 894 150–145 894 236, 87 basesExon 26 : 145 894 885–145 894 977, 93 basesExon 25 : 145 910 448–145 910 636, 189 basesExon 24 : 145 913 478–145 913 549, 72 basesExon 23 : 145 918 131–145 918 232, 102 basesExon 22 : 145 919 348–145 919 491, 144 basesExon 21 : 145 921 167–145 921 392, 226 basesExon 20 : 145 922 286–145 922 348, 63 basesExon 19 : 145 922 663–145 922 836, 174 basesExon 18 : 145 923 643–145 923 785, 143 basesExon 17 : 145 924 739–145 924 846, 108 basesExon 16 : 145 926 204–145 926 296, 93 basesExon 15 : 145 927 189–145 927 277, 89 basesExon 14 : 145 933 057–145 933 178, 122 basesExon 13 : 145 934 907–145 935 163, 257 basesExon 12 : 145 935 278–145 935 441, 164 basesExon 11 : 145 940 723–145 940 801, 79 basesExon 10 : 145 941 623–145 941 874, 252 basesExon 9 : 145 943 143–145 943 802, 660 basesExon 8 : 145 945 381–145 945 637, 257 basesExon 7 : 145 946 233–145 946 341, 109 basesExon 6 : 145 947 493–145 947 643, 151 basesExon 5 : 145 948 272–145 948 350, 79 basesExon 4 : 145 950 264–145 950 482, 219 basesExon 3 : 145 952 349–145 952 478, 130 basesExon 2 : 145 954 690–145 955 354, 665 basesExon 1 : 145 963 731–145 964 358, 628 bases3025201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7,6 kb sur les 79,6 kb du gène ; 5 052 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SHPRH : SNF2 histone linker PHD RING helicase. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/shprh

Vancouver

Dante Labs. Gène SHPRH : SNF2 histone linker PHD RING helicase [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/shprh

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