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Gène

SCFD1

sec1 family domain containing 1

Résumé

Localisation cytogénétique
14q12
Coordonnées
Chromosome 14 : 30 622 319–30 735 850 (GRCh38)
Exons
25 exons sur 113,5 kb
Protéine
642 acides aminés
Aussi appelé
RA410, KIAA0917, STXBP1L2, SLY1
Symboles précédents
C14orf163
Transcrit MANE Select
ENST00000458591.7NM_016106.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SCFD1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SCFD1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 14, avec un crochet à l'emplacement de SCFD1. SCFD1 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 14, de 30 179 085 à 31 179 084.Chromosome 1414q12p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3330,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 Mb31 MbPRKD1 : 29 576 479–30 191 898, brin inversePRKD1G2E3 : 30 559 104–30 620 167, brin directG2E3SCFD1 : 30 622 319–30 735 850, brin directSCFD1COCH : 30 874 438–30 895 501, brin directCOCHSTRN3 : 30 893 561–31 026 553, brin inverseSTRN3AP4S1 : 31 024 922–31 130 996, brin directAP4S1HECTD1 : 31 100 115–31 208 381, brin inverseHECTD1Schéma de SCFD1 : 25 exons sur le brin direct du chromosome 14Exon 1 : 30 622 319–30 622 399, 81 basesExon 2 : 30 628 209–30 628 279, 71 basesExon 3 : 30 630 477–30 630 565, 89 basesExon 4 : 30 633 947–30 634 037, 91 basesExon 5 : 30 638 125–30 638 247, 123 basesExon 6 : 30 639 777–30 639 864, 88 basesExon 7 : 30 643 316–30 643 405, 90 basesExon 8 : 30 649 528–30 649 583, 56 basesExon 9 : 30 650 565–30 650 650, 86 basesExon 10 : 30 653 489–30 653 588, 100 basesExon 11 : 30 670 256–30 670 395, 140 basesExon 12 : 30 673 257–30 673 347, 91 basesExon 13 : 30 673 924–30 673 997, 74 basesExon 14 : 30 674 984–30 675 065, 82 basesExon 15 : 30 694 773–30 694 869, 97 basesExon 16 : 30 700 188–30 700 258, 71 basesExon 17 : 30 702 296–30 702 375, 80 basesExon 18 : 30 705 823–30 705 885, 63 basesExon 19 : 30 707 990–30 708 065, 76 basesExon 20 : 30 715 924–30 715 977, 54 basesExon 21 : 30 719 325–30 719 377, 53 basesExon 22 : 30 721 884–30 721 917, 34 basesExon 23 : 30 722 494–30 722 559, 66 basesExon 24 : 30 734 790–30 734 858, 69 basesExon 25 : 30 735 586–30 735 850, 265 bases15101520255′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,2 kb sur les 113,5 kb du gène ; 1 929 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SCFD1 : sec1 family domain containing 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/scfd1

Vancouver

Dante Labs. Gène SCFD1 : sec1 family domain containing 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/scfd1

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