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Gène

SAMM50

SAMM50 sorting and assembly machinery component

Résumé

Localisation cytogénétique
22q13.31
Coordonnées
Chromosome 22 : 43 955 442–43 996 529 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 41,1 kb
Protéine
469 acides aminés
Aussi appelé
CGI-51, TRG-3, YNL026W, OMP85, TOB55, SAM50
Transcrit MANE Select
ENST00000350028.5NM_015380.5
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SAMM50. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SAMM50

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 22, avec un crochet à l'emplacement de SAMM50. SAMM50 et 8 gènes à proximité sur le chromosome 22, de 43 475 986 à 44 475 985.Chromosome 2222q13.31p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3343,6 Mb43,8 Mb44 Mb44,2 Mb44,4 MbMPPED1 : 43 411 196–43 507 850, brin directMPPED1EFCAB6 : 43 528 744–43 812 337, brin inverseEFCAB6SULT4A1 : 43 824 507–43 862 545, brin inverseSULT4A1PNPLA5 : 43 878 568–43 892 494, brin inversePNPLA5PNPLA3 : 43 923 761–43 964 488, brin directPNPLA3SAMM50 : 43 955 442–43 996 529, brin directSAMM50PARVB : 43 999 211–44 172 939, brin directPARVBPARVG : 44 172 946–44 219 533, brin directPARVGSHISAL1 : 44 243 665–44 332 009, brin inverseSHISAL1Schéma de SAMM50 : 15 exons sur le brin direct du chromosome 22Exon 1 : 43 955 442–43 955 598, 157 basesExon 2 : 43 963 286–43 963 396, 111 basesExon 3 : 43 964 452–43 964 553, 102 basesExon 4 : 43 968 731–43 968 818, 88 basesExon 5 : 43 972 236–43 972 342, 107 basesExon 6 : 43 972 871–43 973 001, 131 basesExon 7 : 43 973 236–43 973 323, 88 basesExon 8 : 43 976 055–43 976 183, 129 basesExon 9 : 43 976 750–43 976 821, 72 basesExon 10 : 43 977 872–43 977 958, 87 basesExon 11 : 43 981 391–43 981 461, 71 basesExon 12 : 43 983 933–43 984 000, 68 basesExon 13 : 43 989 111–43 989 257, 147 basesExon 14 : 43 990 265–43 990 406, 142 basesExon 15 : 43 996 338–43 996 529, 192 bases12468101214155′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,7 kb sur les 41,1 kb du gène ; 1 410 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SAMM50 : SAMM50 sorting and assembly machinery component. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/samm50

Vancouver

Dante Labs. Gène SAMM50 : SAMM50 sorting and assembly machinery component [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/samm50

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