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Gène

RCAN3

regulator of calcineurin 3

Résumé

Localisation cytogénétique
1p36.11
Coordonnées
Chromosome 1 : 24 502 836–24 541 040 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 38,2 kb
Protéine
241 acides aminés
Symboles précédents
DSCR1L2
Transcrit MANE Select
ENST00000374395.9NM_013441.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RCAN3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RCAN3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de RCAN3. RCAN3 et 10 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 24 021 938 à 25 021 937.Chromosome 11p36.11p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4424,2 Mb24,4 Mb24,6 Mb24,8 Mb25 MbMYOM3 : 24 054 822–24 112 190, brin inverseMYOM3IL22RA1 : 24 119 769–24 143 301, brin inverseIL22RA1IFNLR1 : 24 154 168–24 187 959, brin inverseIFNLR1GRHL3 : 24 199 558–24 364 482, brin directGRHL3STPG1 : 24 355 830–24 416 934, brin inverseSTPG1NIPAL3 : 24 413 515–24 476 735, brin directNIPAL3RCAN3 : 24 502 836–24 541 040, brin directRCAN3NCMAP : 24 556 061–24 609 328, brin directNCMAPSRRM1 : 24 631 716–24 673 281, brin directSRRM1CLIC4 : 24 745 342–24 844 324, brin directCLIC4RUNX3 : 24 899 511–24 965 121, brin inverseRUNX3Schéma de RCAN3 : 5 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 24 502 836–24 503 150, 315 basesExon 2 : 24 514 314–24 514 567, 254 basesExon 3 : 24 531 218–24 531 391, 174 basesExon 4 : 24 533 083–24 533 254, 172 basesExon 5 : 24 535 093–24 541 040, 5 948 bases123455′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6,9 kb sur les 38,2 kb du gène ; 726 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de RCAN3

2Facile

Difficulté de séquençage de RCAN3 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de RCAN3 se situent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Facteur aggravant : la part des exons de RCAN3 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0,3 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions4,6 %
  • Teneur en GC11 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RCAN3 : regulator of calcineurin 3. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rcan3

Vancouver

Dante Labs. Gène RCAN3 : regulator of calcineurin 3 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rcan3

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