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Gène

RARRES1

retinoic acid receptor responder 1

Résumé

Localisation cytogénétique
3q25.32
Coordonnées
Chromosome 3 : 158 696 892–158 732 457 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 35,6 kb
Protéine
294 acides aminés
Aussi appelé
TIG1, LXNL
Transcrit MANE Select
ENST00000237696.10NM_206963.2
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RARRES1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RARRES1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de RARRES1. RARRES1 et 7 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 158 214 675 à 159 214 674.Chromosome 33q25.32p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29158,4 Mb158,6 Mb158,8 Mb159 Mb159,2 MbRSRC1 : 158 105 675–158 545 734, brin directRSRC1MLF1 : 158 571 151–158 607 255, brin directMLF1LXN : 158 591 891–158 672 732, brin inverseLXNGFM1 : 158 644 516–158 695 836, brin directGFM1RARRES1 : 158 696 892–158 732 457, brin inverseRARRES1MFSD1 : 158 732 198–158 885 089, brin directMFSD1IQCJ-SCHIP1 : 158 962 235–159 897 358, brin directIQCJ-SCHIP1IQCJ : 158 962 928–159 266 307, brin directIQCJSchéma de RARRES1 : 6 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 6 : 158 696 892–158 697 827, 936 basesExon 5 : 158 697 908–158 697 970, 63 basesExon 4 : 158 704 791–158 704 927, 137 basesExon 3 : 158 710 738–158 710 933, 196 basesExon 2 : 158 713 797–158 713 859, 63 basesExon 1 : 158 732 140–158 732 457, 318 bases6543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,7 kb sur les 35,6 kb du gène ; 885 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de RARRES1

9Facile

Difficulté de séquençage de RARRES1 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de RARRES1 se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.

Facteur aggravant : la part des exons de RARRES1 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Partagé avec le chrY0 %
  • Couverture de la référence0 %
  • Répétitions6,6 %
  • Teneur en GC38 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RARRES1 : retinoic acid receptor responder 1. Consulté le 20 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rarres1

Vancouver

Dante Labs. Gène RARRES1 : retinoic acid receptor responder 1 [Internet]. [consulté le 20 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rarres1

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