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Gène

RABGGTA

Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha

Résumé

Localisation cytogénétique
14q12
Coordonnées
Chromosome 14 : 24 265 538–24 271 597 (GRCh38)
Exons
17 exons sur 6,1 kb
Protéine
567 acides aminés
Aussi appelé
PTAR3
Transcrit MANE Select
ENST00000216840.11NM_182836.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de RABGGTA

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 14, avec un crochet à l'emplacement de RABGGTA. RABGGTA et 44 gènes à proximité sur le chromosome 14, de 23 768 568 à 24 768 567.Chromosome 1414q12p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3323,8 Mb24 Mb24,2 Mb24,4 Mb24,6 MbDHRS4 : 23 953 713–23 969 279, brin directDHRS4DHRS4L2 : 23 969 874–24 006 408, brin directDHRS4L2CARMIL3 : 24 051 387–24 069 734, brin directCARMIL3CPNE6 : 24 070 837–24 078 100, brin directCPNE6NRL : 24 078 662–24 115 026, brin inversePCK2 : 24 094 053–24 110 598, brin directPCK2DCAF11 : 24 114 010–24 125 615, brin direct : 24 120 956–24 131 829, brin directFITM1 : 24 130 659–24 132 849, brin directPSME1 : 24 136 142–24 138 967, brin directEMC9 : 24 138 958–24 142 023, brin inverseEMC9PSME2 : 24 143 360–24 147 570, brin inverseRNF31 : 24 146 683–24 160 660, brin directRNF31 : 24 147 548–24 166 452, brin directIRF9 : 24 161 101–24 168 043, brin directREC8 : 24 171 853–24 180 923, brin directIPO4 : 24 180 043–24 188 990, brin inverseIPO4 : 24 180 395–24 190 416, brin inverseTM9SF1 : 24 189 140–24 196 287, brin inverse : 24 189 157–24 213 473, brin inverseTSSK4 : 24 205 696–24 208 362, brin directCHMP4A : 24 209 581–24 213 830, brin inverseMDP1 : 24 213 939–24 216 070, brin inverseNEDD8-MDP1 : 24 213 955–24 232 352, brin inverseNEDD8 : 24 216 802–24 232 539, brin inverseGMPR2 : 24 232 211–24 239 246, brin directGMPR2TINF2 : 24 234 009–24 242 666, brin inverseTINF2TGM1 : 24 249 114–24 264 432, brin inverseTGM1RABGGTA : 24 265 538–24 271 597, brin inverseRABGGTADHRS1 : 24 290 594–24 300 136, brin inverseDHRS1NOP9 : 24 299 825–24 309 124, brin directNOP9CIDEB : 24 305 187–24 311 454, brin inverseCIDEBLTB4R2 : 24 305 734–24 312 053, brin directLTB4R : 24 311 188–24 318 036, brin directADCY4 : 24 318 091–24 335 208, brin inverseRIPK3 : 24 336 025–24 340 022, brin inverseNFATC4 : 24 365 673–24 379 613, brin directNFATC4NYNRIN : 24 398 861–24 419 304, brin directNYNRINKHNYN : 24 423 052–24 441 846, brin directKHNYNCBLN3 : 24 423 886–24 430 972, brin inverseCBLN3SDR39U1 : 24 439 651–24 442 905, brin inverseSDR39U1CMA1 : 24 505 353–24 508 271, brin inverseCMA1CTSG : 24 573 518–24 576 250, brin inverseCTSGGZMH : 24 606 480–24 609 821, brin inverseGZMHGZMB : 24 630 954–24 634 277, brin inverseGZMBSchéma de RABGGTA : 17 exons sur le brin inverse du chromosome 14Exon 17 : 24 265 538–24 265 763, 226 basesExon 16 : 24 266 430–24 266 517, 88 basesExon 15 : 24 266 776–24 266 889, 114 basesExon 14 : 24 267 660–24 267 776, 117 basesExon 13 : 24 267 870–24 267 958, 89 basesExon 12 : 24 268 110–24 268 198, 89 basesExon 11 : 24 268 369–24 268 420, 52 basesExon 10 : 24 268 514–24 268 619, 106 basesExon 9 : 24 268 725–24 268 826, 102 basesExon 8 : 24 268 911–24 268 993, 83 basesExon 7 : 24 269 080–24 269 163, 84 basesExon 6 : 24 269 491–24 269 694, 204 basesExon 5 : 24 269 953–24 270 140, 188 basesExon 4 : 24 270 334–24 270 458, 125 basesExon 3 : 24 270 837–24 270 947, 111 basesExon 2 : 24 271 113–24 271 169, 57 basesExon 1 : 24 271 487–24 271 597, 111 bases17161514131211109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,9 kb sur les 6,1 kb du gène ; 1 704 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RABGGTA : Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rabggta

Vancouver

Dante Labs. Gène RABGGTA : Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rabggta

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