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Gène

PTPRM

protein tyrosine phosphatase receptor type M

Résumé

Localisation cytogénétique
18p11.23
Coordonnées
Chromosome 18 : 7 567 316–8 406 856 (GRCh38)
Exons
33 exons sur 839,5 kb
Protéine
1 465 acides aminés
Aussi appelé
RPTPU, hR-PTPu
Symboles précédents
PTPRL1
Transcrit MANE Select
ENST00000580170.6NM_001105244.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PTPRM. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PTPRM

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 18, avec un crochet à l'emplacement de PTPRM. PTPRM et 7 gènes à proximité sur le chromosome 18, de 6 727 775 à 9 246 397.Chromosome 1818p11.23p11.32p11.31p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q237 Mb7,5 Mb8 Mb8,5 Mb9 MbARHGAP28 : 6 729 668–6 915 716, brin directARHGAP28LAMA1 : 6 941 742–7 117 859, brin inverseLAMA1LRRC30 : 7 231 089–7 232 044, brin directLRRC30PTPRM : 7 567 316–8 406 856, brin directPTPRMRAB12 : 8 609 405–8 639 383, brin directRAB12MTCL1 : 8 705 228–8 832 780, brin directMTCL1NDUFV2 : 9 102 433–9 134 570, brin directNDUFV2ANKRD12 : 9 136 228–9 285 985, brin directANKRD12Schéma de PTPRM : 33 exons sur le brin direct du chromosome 18Exon 1 : 7 567 316–7 567 891, 576 basesExon 2 : 7 774 149–7 774 271, 123 basesExon 3 : 7 888 106–7 888 377, 272 basesExon 4 : 7 906 505–7 906 583, 79 basesExon 5 : 7 926 568–7 926 683, 116 basesExon 6 : 7 949 181–7 949 355, 175 basesExon 7 : 7 955 121–7 955 414, 294 basesExon 8 : 8 069 686–8 069 994, 309 basesExon 9 : 8 076 455–8 076 564, 110 basesExon 10 : 8 085 671–8 085 872, 202 basesExon 11 : 8 088 749–8 088 851, 103 basesExon 12 : 8 113 486–8 113 759, 274 basesExon 13 : 8 114 791–8 114 827, 37 basesExon 14 : 8 143 647–8 143 779, 133 basesExon 15 : 8 244 058–8 244 209, 152 basesExon 16 : 8 247 845–8 247 919, 75 basesExon 17 : 8 248 150–8 248 176, 27 basesExon 18 : 8 252 488–8 252 499, 12 basesExon 19 : 8 253 227–8 253 414, 188 basesExon 20 : 8 296 368–8 296 455, 88 basesExon 21 : 8 314 781–8 314 857, 77 basesExon 22 : 8 319 178–8 319 214, 37 basesExon 23 : 8 343 423–8 343 520, 98 basesExon 24 : 8 370 890–8 371 006, 117 basesExon 25 : 8 376 046–8 376 200, 155 basesExon 26 : 8 376 462–8 376 597, 136 basesExon 27 : 8 378 265–8 378 414, 150 basesExon 28 : 8 379 167–8 379 340, 174 basesExon 29 : 8 380 296–8 380 427, 132 basesExon 30 : 8 384 561–8 384 686, 126 basesExon 31 : 8 387 072–8 387 235, 164 basesExon 32 : 8 394 476–8 394 611, 136 basesExon 33 : 8 406 109–8 406 856, 748 bases1102030335′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,6 kb sur les 839,5 kb du gène ; 4 398 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène PTPRM : protein tyrosine phosphatase receptor type M. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptprm

Vancouver

Dante Labs. Gène PTPRM : protein tyrosine phosphatase receptor type M [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptprm

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