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Gène

PRPF38A

pre-mRNA processing factor 38A

Résumé

Localisation cytogénétique
1p32.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 52 404 602–52 420 836 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 16,2 kb
Protéine
312 acides aminés
Aussi appelé
FLJ14936, Prp38
Transcrit MANE Select
ENST00000257181.10NM_032864.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PRPF38A. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PRPF38A

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de PRPF38A. PRPF38A et 15 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 51 912 719 à 52 912 718.Chromosome 11p32.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4452 Mb52,2 Mb52,4 Mb52,6 Mb52,8 MbRAB3B : 51 907 956–51 990 746, brin inverseRAB3BTXNDC12 : 52 020 130–52 056 188, brin inverseTXNDC12 : 52 020 153–52 033 350, brin inverseKTI12 : 52 032 103–52 033 810, brin inverseKTI12BTF3L4 : 52 056 199–52 101 453, brin directBTF3L4ZFYVE9 : 52 141 883–52 348 671, brin directZFYVE9CC2D1B : 52 345 714–52 366 318, brin inverseCC2D1BORC1 : 52 370 994–52 404 492, brin inverseORC1PRPF38A : 52 404 602–52 420 836, brin directPRPF38ATUT4 : 52 408 282–52 553 504, brin inverseTUT4GPX7 : 52 602 280–52 609 143, brin directGPX7SHISAL2A : 52 633 168–52 670 143, brin directSHISAL2ACOA7 : 52 662 885–52 698 369, brin inverseCOA7ZYG11B : 52 726 390–52 827 336, brin directZYG11BZYG11A : 52 842 511–52 894 998, brin directZYG11AECHDC2 : 52 895 910–52 927 212, brin inverseECHDC2Schéma de PRPF38A : 10 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 52 404 602–52 404 879, 278 basesExon 2 : 52 405 680–52 405 839, 160 basesExon 3 : 52 408 569–52 408 690, 122 basesExon 4 : 52 411 115–52 411 200, 86 basesExon 5 : 52 412 514–52 412 624, 111 basesExon 6 : 52 413 879–52 413 991, 113 basesExon 7 : 52 414 621–52 414 647, 27 basesExon 8 : 52 414 762–52 414 859, 98 basesExon 9 : 52 415 338–52 415 386, 49 basesExon 10 : 52 416 648–52 420 836, 4 189 bases12468105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,2 kb sur les 16,2 kb du gène ; 939 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PRPF38A : pre-mRNA processing factor 38A. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/prpf38a

Vancouver

Dante Labs. Gène PRPF38A : pre-mRNA processing factor 38A [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/prpf38a

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