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Gène

PPARA

peroxisome proliferator activated receptor alpha

Résumé

Localisation cytogénétique
22q13.31
Coordonnées
Chromosome 22 : 46 150 526–46 243 755 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 93,2 kb
Protéine
468 acides aminés
Aussi appelé
hPPAR, NR1C1
Symboles précédents
PPAR
Transcrit MANE Select
ENST00000407236.6NM_005036.6
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PPARA. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PPARA

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 22, avec un crochet à l'emplacement de PPARA. PPARA et 10 gènes à proximité sur le chromosome 22, de 45 697 141 à 46 697 140.Chromosome 2222q13.31p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3345,8 Mb46 Mb46,2 Mb46,4 Mb46,6 MbATXN10 : 45 671 710–45 856 028, brin directATXN10WNT7B : 45 920 366–45 977 260, brin inverseWNT7BPPARA : 46 150 526–46 243 755, brin directPPARACDPF1 : 46 241 405–46 250 897, brin inverseCDPF1PKDREJ : 46 255 663–46 263 343, brin inversePKDREJTTC38 : 46 267 961–46 295 097, brin directTTC38GTSE1 : 46 296 870–46 330 810, brin directGTSE1TRMU : 46 330 875–46 357 344, brin directTRMUCELSR1 : 46 360 834–46 537 638, brin inverseCELSR1GRAMD4 : 46 575 636–46 682 755, brin directGRAMD4CERK : 46 684 409–46 738 319, brin inverseCERKSchéma de PPARA : 9 exons sur le brin direct du chromosome 22Exon 1 : 46 150 526–46 150 652, 127 basesExon 2 : 46 151 888–46 151 970, 83 basesExon 3 : 46 176 753–46 176 836, 84 basesExon 4 : 46 198 342–46 198 591, 250 basesExon 5 : 46 215 173–46 215 333, 161 basesExon 6 : 46 218 263–46 218 401, 139 basesExon 7 : 46 219 812–46 220 014, 203 basesExon 8 : 46 231 792–46 232 239, 448 basesExon 9 : 46 235 133–46 243 755, 8 623 bases1595′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 10,1 kb sur les 93,2 kb du gène ; 1 407 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de PPARA

1Facile

Difficulté de séquençage de PPARA avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de PPARA se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de PPARA dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité0,7 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions2,7 %
  • Teneur en GC3,5 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène PPARA : peroxisome proliferator activated receptor alpha. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ppara

Vancouver

Dante Labs. Gène PPARA : peroxisome proliferator activated receptor alpha [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ppara

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