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Gène

OR10H1

olfactory receptor family 10 subfamily H member 1

Résumé

Localisation cytogénétique
19p13.12
Coordonnées
Chromosome 19 : 15 804 549–15 815 664 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 11,1 kb
Protéine
318 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000641419.1NM_013940.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore OR10H1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de OR10H1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de OR10H1. OR10H1 et 22 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 15 310 107 à 16 310 106.Chromosome 1919p13.12p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4315,4 Mb15,6 Mb15,8 Mb16 Mb16,2 MbBRD4 : 15 235 519–15 332 547, brin inverseBRD4AKAP8 : 15 353 385–15 379 862, brin inverseAKAP8AKAP8L : 15 380 046–15 419 141, brin inverseAKAP8LWIZ : 15 419 978–15 450 038, brin inverseWIZRASAL3 : 15 451 624–15 464 583, brin inverseRASAL3PGLYRP2 : 15 468 625–15 498 956, brin inversePGLYRP2CYP4F22 : 15 508 477–15 552 317, brin directCYP4F22CYP4F8 : 15 615 218–15 630 639, brin directCYP4F8CYP4F3 : 15 640 795–15 662 825, brin directCYP4F3CYP4F12 : 15 673 018–15 698 819, brin directCYP4F12OR10H2 : 15 728 024–15 729 052, brin directOR10H2OR10H3 : 15 737 985–15 742 343, brin directOR10H3OR10H5 : 15 787 661–15 800 357, brin directOR10H5OR10H1 : 15 804 549–15 815 664, brin inverseOR10H1CYP4F2 : 15 877 893–15 900 528, brin inverseCYP4F2CYP4F11 : 15 912 367–15 934 933, brin inverseCYP4F11OR10H4 : 15 944 299–15 950 350, brin directOR10H4TPM4 : 16 067 021–16 103 011, brin directTPM4RAB8A : 16 111 653–16 134 235, brin directRAB8AHSH2D : 16 134 028–16 158 575, brin directHSH2DCIB3 : 16 161 368–16 173 525, brin inverseCIB3FAM32A : 16 185 378–16 192 048, brin directFAM32AAP1M1 : 16 197 854–16 245 906, brin directAP1M1Schéma de OR10H1 : 4 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 4 : 15 804 549–15 808 048, 3 500 basesExon 3 : 15 808 725–15 808 841, 117 basesExon 2 : 15 812 230–15 812 878, 649 basesExon 1 : 15 815 555–15 815 664, 110 bases43215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,4 kb sur les 11,1 kb du gène ; 957 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de OR10H1

32Modérée

Difficulté de séquençage de OR10H1 avec des lectures courtes, sur 100

Certains exons de OR10H1 se situent dans des zones où les lectures courtes peuvent manquer une variation ou la mal placer.

Facteur aggravant : la part des exons de OR10H1 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité29 %
  • Homologie0 %
  • Partagé avec le chrY0 %
  • Couverture de la référence0 %
  • Répétitions14 %
  • Teneur en GC0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène OR10H1 : olfactory receptor family 10 subfamily H member 1. Consulté le 20 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/or10h1

Vancouver

Dante Labs. Gène OR10H1 : olfactory receptor family 10 subfamily H member 1 [Internet]. [consulté le 20 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/or10h1

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