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Gène

MGAT5

alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase

Résumé

Localisation cytogénétique
2q21.2-q21.3
Coordonnées
Chromosome 2 : 134 254 072–134 454 621 (GRCh38)
Exons
16 exons sur 200,6 kb
Protéine
741 acides aminés
Aussi appelé
GNT-V, MGAT5A
Transcrit MANE Select
ENST00000281923.4NM_002410.5
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore MGAT5. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de MGAT5

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de MGAT5. MGAT5 et 2 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 133 854 347 à 134 854 346.Chromosome 22q21.2-q21.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3134 Mb134,2 Mb134,4 Mb134,6 Mb134,8 MbMGAT5 : 134 254 072–134 454 621, brin directMGAT5TMEM163 : 134 455 759–134 719 168, brin inverseTMEM163ACMSD : 134 838 312–134 902 910, brin directACMSDSchéma de MGAT5 : 16 exons sur le brin direct du chromosome 2Exon 1 : 134 254 072–134 254 644, 573 basesExon 2 : 134 270 386–134 270 550, 165 basesExon 3 : 134 317 529–134 317 605, 77 basesExon 4 : 134 318 650–134 318 739, 90 basesExon 5 : 134 336 217–134 336 288, 72 basesExon 6 : 134 338 259–134 338 420, 162 basesExon 7 : 134 341 590–134 341 759, 170 basesExon 8 : 134 344 930–134 345 064, 135 basesExon 9 : 134 349 805–134 349 938, 134 basesExon 10 : 134 362 275–134 362 408, 134 basesExon 11 : 134 402 988–134 403 137, 150 basesExon 12 : 134 412 869–134 413 015, 147 basesExon 13 : 134 422 803–134 422 919, 117 basesExon 14 : 134 428 365–134 428 439, 75 basesExon 15 : 134 441 758–134 441 915, 158 basesExon 16 : 134 448 649–134 454 621, 5 973 bases12468101214165′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 8,3 kb sur les 200,6 kb du gène ; 2 226 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de MGAT5

0Faible

Difficulté de séquençage de MGAT5 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions2,5 %
  • Teneur en GC0 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène MGAT5 : alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/mgat5

Vancouver

Dante Labs. Gène MGAT5 : alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/mgat5

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