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Gène

LRFN1

leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.2
Coordonnées
Chromosome 19 : 39 306 566–39 320 863 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 14,3 kb
Protéine
771 acides aminés
Aussi appelé
KIAA1484, SALM2
Transcrit MANE Select
ENST00000248668.5NM_020862.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore LRFN1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de LRFN1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de LRFN1. LRFN1 et 38 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 38 813 715 à 39 813 714.Chromosome 1919q13.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4339 Mb39,2 Mb39,4 Mb39,6 Mb39,8 MbECH1 : 38 815 415–38 831 874, brin inverseECH1 : 38 817 471–38 840 178, brin inverseHNRNPL : 38 836 370–38 852 347, brin inverseHNRNPLRINL : 38 867 830–38 878 275, brin inverseRINLSIRT2 : 38 878 555–38 900 501, brin inverseNFKBIB : 38 899 700–38 908 893, brin directCCER2 : 38 908 980–38 912 252, brin inverseSARS2 : 38 915 265–38 930 779, brin inverseSARS2 : 38 915 404–38 949 855, brin inverseMRPS12 : 38 930 917–38 937 406, brin directMRPS12FBXO17 : 38 941 401–38 976 773, brin inverseFBXO17FBXO27 : 38 990 714–39 033 773, brin inverseFBXO27ACP7 : 39 083 913–39 111 497, brin directACP7PAK4 : 39 125 728–39 182 816, brin directPAK4NCCRP1 : 39 196 917–39 201 884, brin directNCCRP1SYCN : 39 202 825–39 204 283, brin inverseSYCNIFNL3 : 39 243 455–39 245 250, brin inverseIFNL3IFNL4 : 39 246 314–39 248 856, brin inverseIFNL4IFNL2 : 39 268 396–39 270 188, brin directIFNL2IFNL1 : 39 296 407–39 298 673, brin directIFNL1LRFN1 : 39 306 566–39 320 863, brin inverseLRFN1GMFG : 39 328 351–39 342 372, brin inverseGMFGSAMD4B : 39 342 404–39 385 710, brin directSAMD4BPAF1 : 39 385 629–39 391 154, brin inversePAF1MED29 : 39 391 303–39 400 641, brin directMED29ZFP36 : 39 406 412–39 411 635, brin directZFP36PLEKHG2 : 39 412 546–39 428 415, brin directRPS16 : 39 433 136–39 436 131, brin inverseRPS16SUPT5H : 39 436 156–39 476 670, brin directSUPT5HTIMM50 : 39 479 795–39 493 785, brin directTIMM50DLL3 : 39 498 895–39 508 481, brin directDLL3SELENOV : 39 515 139–39 520 675, brin directSELENOVEID2B : 39 525 527–39 532 881, brin inverseEID2BEID2 : 39 536 438–39 540 233, brin inverseLGALS13 : 39 602 490–39 607 476, brin directLGALS13LGALS16 : 39 655 908–39 660 647, brin directLGALS16LGALS14 : 39 704 359–39 727 560, brin directLGALS14CLC : 39 731 255–39 755 237, brin inverseCLCLEUTX : 39 776 595–39 786 291, brin directLEUTXSchéma de LRFN1 : 5 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 5 : 39 306 566–39 308 542, 1 977 basesExon 4 : 39 313 931–39 315 373, 1 443 basesExon 3 : 39 316 082–39 316 136, 55 basesExon 2 : 39 318 326–39 318 358, 33 basesExon 1 : 39 320 793–39 320 863, 71 bases543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,6 kb sur les 14,3 kb du gène ; 2 316 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène LRFN1 : leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/lrfn1

Vancouver

Dante Labs. Gène LRFN1 : leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/lrfn1

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