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Gène

KANSL3

KAT8 regulatory NSL complex subunit 3

Résumé

Localisation cytogénétique
2q11.2
Coordonnées
Chromosome 2 : 96 593 172–96 638 312 (GRCh38)
Exons
21 exons sur 45,1 kb
Protéine
878 acides aminés
Aussi appelé
FLJ10081, Rcd1, NSL3
Symboles précédents
KIAA1310
Transcrit MANE Select
ENST00000431828.6NM_001115016.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore KANSL3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de KANSL3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de KANSL3. KANSL3 et 21 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 96 115 742 à 97 115 741.Chromosome 22q11.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.396,2 Mb96,4 Mb96,6 Mb96,8 Mb97 MbADRA2B : 96 112 876–96 116 571, brin inverseADRA2BASTL : 96 122 818–96 138 564, brin inverseASTLDUSP2 : 96 143 166–96 145 447, brin inverseDUSP2STARD7 : 96 184 859–96 208 854, brin inverseSTARD7TMEM127 : 96 248 500–96 266 082, brin inverseTMEM127CIAO1 : 96 266 159–96 274 173, brin directCIAO1SNRNP200 : 96 274 336–96 321 271, brin inverseSNRNP200ITPRIPL1 : 96 324 977–96 330 517, brin directITPRIPL1NCAPH : 96 335 728–96 377 091, brin directNCAPHNEURL3 : 96 497 644–96 508 153, brin inverseNEURL3ARID5A : 96 536 699–96 552 639, brin directARID5AKANSL3 : 96 593 172–96 638 312, brin inverseKANSL3FER1L5 : 96 642 737–96 704 887, brin directFER1L5LMAN2L : 96 704 824–96 740 087, brin inverseLMAN2LCNNM4 : 96 760 858–96 811 888, brin directCNNM4CNNM3 : 96 816 238–96 837 543, brin directCNNM3ANKRD23 : 96 821 811–96 857 934, brin inverseANKRD23ANKRD39 : 96 836 240–96 858 070, brin inverseANKRD39SEMA4C : 96 859 718–96 873 840, brin inverseSEMA4CFAM178B : 96 875 882–96 986 580, brin inverseFAM178BFAHD2B : 97 078 759–97 094 903, brin inverseFAHD2BANKRD36 : 97 113 112–97 264 521, brin directANKRD36Schéma de KANSL3 : 21 exons sur le brin inverse du chromosome 2Exon 21 : 96 593 172–96 595 631, 2 460 basesExon 20 : 96 601 643–96 601 776, 134 basesExon 19 : 96 602 116–96 602 338, 223 basesExon 18 : 96 602 753–96 602 862, 110 basesExon 17 : 96 604 250–96 604 380, 131 basesExon 16 : 96 604 779–96 604 863, 85 basesExon 15 : 96 605 320–96 605 511, 192 basesExon 14 : 96 608 508–96 608 664, 157 basesExon 13 : 96 608 864–96 609 064, 201 basesExon 12 : 96 609 499–96 609 562, 64 basesExon 11 : 96 610 726–96 610 883, 158 basesExon 10 : 96 611 064–96 611 138, 75 basesExon 9 : 96 612 282–96 612 353, 72 basesExon 8 : 96 612 462–96 612 563, 102 basesExon 7 : 96 612 818–96 612 934, 117 basesExon 6 : 96 613 488–96 613 619, 132 basesExon 5 : 96 619 359–96 619 544, 186 basesExon 4 : 96 619 672–96 619 762, 91 basesExon 3 : 96 631 312–96 631 482, 171 basesExon 2 : 96 636 921–96 637 185, 265 basesExon 1 : 96 638 283–96 638 312, 30 bases21201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,2 kb sur les 45,1 kb du gène ; 2 637 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de KANSL3

0Facile

Difficulté de séquençage de KANSL3 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de KANSL3 se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.

Facteur aggravant : la part des exons de KANSL3 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Partagé avec le chrY0 %
  • Couverture de la référence0 %
  • Répétitions0,5 %
  • Teneur en GC0,6 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène KANSL3 : KAT8 regulatory NSL complex subunit 3. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/kansl3

Vancouver

Dante Labs. Gène KANSL3 : KAT8 regulatory NSL complex subunit 3 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/kansl3

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