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Gène

IFI16

interferon gamma inducible protein 16

Résumé

Localisation cytogénétique
1q23.1
Coordonnées
Chromosome 1 : 159 009 907–159 055 151 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 45,2 kb
Protéine
785 acides aminés
Aussi appelé
IFNGIP1, PYHIN2
Transcrit MANE Select
ENST00000295809.12NM_001376587.1
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore IFI16. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de IFI16

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de IFI16. IFI16 et 20 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 158 532 529 à 159 532 528.Chromosome 11q23.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44158,6 Mb158,8 Mb159 Mb159,2 Mb159,4 MbOR6Y1 : 158 544 550–158 554 405, brin inverseOR6Y1OR6P1 : 158 560 606–158 570 580, brin inverseOR6P1OR10X1 : 158 578 919–158 579 899, brin inverseOR10X1OR10Z1 : 158 605 268–158 612 514, brin directOR10Z1SPTA1 : 158 610 704–158 686 715, brin inverseSPTA1OR6K2 : 158 699 678–158 700 652, brin inverseOR6K2OR6K3 : 158 716 327–158 720 720, brin inverseOR6K3OR6N1 : 158 747 814–158 772 195, brin inverseOR6N1OR6K6 : 158 754 720–158 755 891, brin directOR6K6OR6N2 : 158 774 222–158 781 204, brin inverseOR6N2MNDA : 158 802 264–158 849 517, brin directMNDAPYHIN1 : 158 930 779–158 977 059, brin directPYHIN1PYDC5 : 158 999 971–159 002 751, brin inversePYDC5IFI16 : 159 009 907–159 055 151, brin directIFI16AIM2 : 159 056 129–159 188 222, brin inverseAIM2CADM3 : 159 171 574–159 203 313, brin directCADM3ACKR1 : 159 204 568–159 206 500, brin directACKR1FCER1A : 159 289 714–159 308 224, brin directFCER1AOR10J3 : 159 313 720–159 314 659, brin inverseOR10J3OR10J4 : 159 432 204–159 433 138, brin directOR10J4OR10J1 : 159 437 845–159 443 078, brin directOR10J1Schéma de IFI16 : 12 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 159 009 907–159 010 161, 255 basesExon 2 : 159 014 661–159 014 945, 285 basesExon 3 : 159 015 872–159 015 987, 116 basesExon 4 : 159 016 533–159 016 700, 168 basesExon 5 : 159 018 229–159 018 651, 423 basesExon 6 : 159 020 341–159 020 529, 189 basesExon 7 : 159 032 524–159 032 691, 168 basesExon 8 : 159 045 297–159 045 464, 168 basesExon 9 : 159 049 432–159 049 599, 168 basesExon 10 : 159 051 679–159 052 098, 420 basesExon 11 : 159 053 533–159 053 724, 192 basesExon 12 : 159 054 821–159 055 151, 331 bases1246810125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,9 kb sur les 45,2 kb du gène ; 2 358 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène IFI16 : interferon gamma inducible protein 16. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ifi16

Vancouver

Dante Labs. Gène IFI16 : interferon gamma inducible protein 16 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ifi16

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