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Gène

CFC1B

cryptic, EGF-CFC family member 1B

Résumé

Localisation cytogénétique
2q21.1
Coordonnées
Chromosome 2 : 130 521 222–130 528 603 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 7,4 kb
Protéine
223 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000281882.8NM_001079530.2
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CFC1B. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CFC1B

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de CFC1B. CFC1B et 14 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 130 024 913 à 131 024 912.Chromosome 22q21.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3130,2 Mb130,4 Mb130,6 Mb130,8 Mb131 MbPOTEF : 130 073 535–130 129 371, brin inversePOTEFCCDC74B : 130 139 287–130 145 134, brin inverseCCDC74BSMPD4 : 130 150 745–130 183 922, brin inverseSMPD4MZT2B : 130 181 737–130 190 729, brin directMZT2BTUBA3E : 130 191 743–130 198 461, brin inverseTUBA3EVMA22 : 130 337 922–130 342 699, brin inverseVMA22IMP4 : 130 342 403–130 348 550, brin directIMP4PTPN18 : 130 356 026–130 375 409, brin directPTPN18POTEI : 130 459 455–130 509 707, brin inversePOTEICFC1B : 130 521 222–130 528 603, brin directCFC1BCFC1 : 130 592 165–130 599 575, brin inverseCFC1POTEJ : 130 611 440–130 658 037, brin directPOTEJGPR148 : 130 729 070–130 730 336, brin directGPR148AMER3 : 130 755 532–130 768 134, brin directAMER3ARHGEF4 : 130 836 864–131 047 263, brin directARHGEF4Schéma de CFC1B : 6 exons sur le brin direct du chromosome 2Exon 1 : 130 521 222–130 521 507, 286 basesExon 2 : 130 521 813–130 521 862, 50 basesExon 3 : 130 521 957–130 522 130, 174 basesExon 4 : 130 522 790–130 522 904, 115 basesExon 5 : 130 523 169–130 523 278, 110 basesExon 6 : 130 527 696–130 528 603, 908 bases1234565′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,6 kb sur les 7,4 kb du gène ; 672 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de CFC1B

69Élevée

Difficulté de séquençage de CFC1B avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité100 %
  • Homologie100 %
  • Répétitions0 %
  • Teneur en GC42 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CFC1B : cryptic, EGF-CFC family member 1B. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/cfc1b

Vancouver

Dante Labs. Gène CFC1B : cryptic, EGF-CFC family member 1B [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/cfc1b

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