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Gène

CDK5RAP1

CDK5RAP1 mitochondrial tRNA methylthiotransferase

Résumé

Localisation cytogénétique
20q11.21
Coordonnées
Chromosome 20 : 33 358 839–33 401 519 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 42,7 kb
Protéine
587 acides aminés
Aussi appelé
CGI-05, HSPC167, C42
Symboles précédents
C20orf34
Transcrit MANE Select
ENST00000346416.7NM_016408.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CDK5RAP1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CDK5RAP1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de CDK5RAP1. CDK5RAP1 et 19 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 32 880 179 à 33 880 178.Chromosome 2020q11.21p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3333 Mb33,2 Mb33,4 Mb33,6 Mb33,8 MbEFCAB8 : 32 858 923–32 961 845, brin directEFCAB8SUN5 : 32 983 773–33 004 433, brin inverseSUN5BPIFB2 : 33 007 696–33 023 709, brin directBPIFB2BPIFB6 : 33 029 189–33 044 230, brin directBPIFB6BPIFB3 : 33 053 903–33 073 847, brin directBPIFB3BPIFB4 : 33 079 643–33 111 751, brin directBPIFB4BPIFA2 : 33 161 768–33 181 412, brin directBPIFA2BPIFA3 : 33 217 310–33 227 806, brin directBPIFA3BPIFA1 : 33 235 987–33 243 311, brin directBPIFA1BPIFB1 : 33 273 480–33 310 382, brin directBPIFB1CDK5RAP1 : 33 358 839–33 401 519, brin inverseCDK5RAP1SNTA1 : 33 407 955–33 443 897, brin inverseSNTA1CBFA2T2 : 33 490 060–33 650 036, brin directCBFA2T2NECAB3 : 33 657 087–33 674 473, brin inverseNECAB3C20orf144 : 33 662 327–33 665 619, brin directC20orf144ACTL10 : 33 666 943–33 668 525, brin directACTL10E2F1 : 33 675 477–33 686 426, brin inverseE2F1PXMP4 : 33 702 758–33 720 412, brin inverseZNF341 : 33 731 657–33 792 269, brin directZNF341CHMP4B : 33 811 253–33 854 366, brin directCHMP4BSchéma de CDK5RAP1 : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 20Exon 14 : 33 358 839–33 359 123, 285 basesExon 13 : 33 360 351–33 360 491, 141 basesExon 12 : 33 366 859–33 367 008, 150 basesExon 11 : 33 370 499–33 370 629, 131 basesExon 10 : 33 372 642–33 372 697, 56 basesExon 9 : 33 374 115–33 374 212, 98 basesExon 8 : 33 379 461–33 379 691, 231 basesExon 7 : 33 385 650–33 385 770, 121 basesExon 6 : 33 387 323–33 387 533, 211 basesExon 5 : 33 392 142–33 392 242, 101 basesExon 4 : 33 394 032–33 394 066, 35 basesExon 3 : 33 395 013–33 395 116, 104 basesExon 2 : 33 396 761–33 397 084, 324 basesExon 1 : 33 401 428–33 401 519, 92 bases14131211109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,1 kb sur les 42,7 kb du gène ; 1 764 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CDK5RAP1 : CDK5RAP1 mitochondrial tRNA methylthiotransferase. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/cdk5rap1

Vancouver

Dante Labs. Gène CDK5RAP1 : CDK5RAP1 mitochondrial tRNA methylthiotransferase [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/cdk5rap1

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