Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

SPATA31C2

SPATA31 subfamily C member 2

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
9q22.1
Koordinaatit
Kromosomi 9: 88 129 305–88 138 475 (GRCh38)
Eksonit
4 eksonia 9,2 kb:n alueella
Proteiini
1 134 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
DKFZP434M131
Aiemmat symbolit
FAM75C2
MANE Select -transkripti
ENST00000324915.6NM_001350978.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SPATA31C2. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SPATA31C2-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 9, jossa hakasulke osoittaa SPATA31C2-geenin sijainnin. SPATA31C2 ja 8 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 9, välillä 87 633 890–88 633 889.Kromosomi 99q22.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.387,8 Mb88 Mb88,2 Mb88,4 Mb88,6 MbDAPK1: 87 497 203–87 709 073, juoste eteenpäinDAPK1CTSL: 87 724 051–87 731 469, juoste eteenpäinCTSLSPATA31E1: 87 882 877–87 888 903, juoste eteenpäinSPATA31E1SPATA31C1: 87 914 488–87 923 657, juoste eteenpäinSPATA31C1: 87 956 214–87 956 883, juoste eteenpäinCDK20: 87 964 905–87 974 816, juoste taaksepäinCDK20SPATA31C2: 88 129 305–88 138 475, juoste taaksepäinSPATA31C2SPIN1: 88 387 434–88 480 349, juoste eteenpäinSPIN1NXNL2: 88 534 033–88 584 510, juoste eteenpäinNXNL2SPATA31C2-kaavio: 4 eksonia kromosomin 9 juosteella, taaksepäinEkson 4: 88 129 305–88 132 710, 3 406 emästäEkson 3: 88 132 966–88 133 026, 61 emästäEkson 2: 88 133 594–88 133 669, 76 emästäEkson 1: 88 138 258–88 138 475, 218 emästä43215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,8 kb geenin 9,2 kb:stä; 3 405 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: SPATA31C2

64Vaikea

Kuinka vaikea SPATA31C2 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Suuri osa geenistä SPATA31C2 sijaitsee alueilla, joilla lyhyet lukemat voivat jättää muutoksen huomaamatta tai sijoittaa sen väärin.

Lisäksi vaikuttaa: geenin SPATA31C2 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus95 %
  • Homologia100 %
  • Toistot0,8 %
  • GC-pitoisuus2,1 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SPATA31C2-geeni: SPATA31 subfamily C member 2. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/spata31c2

Vancouver

Dante Labs. SPATA31C2-geeni: SPATA31 subfamily C member 2 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/spata31c2

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test