Geeni
RFK
riboflavin kinase
- HGNC 30324↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000135002↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 55312↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 9q21.13
- Koordinaatit
- Kromosomi 9: 76 385 526–76 394 426 (GRCh38)
- Eksonit
- 4 eksonia 8,9 kb:n alueella
- Proteiini
- 155 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- FLJ11149, RIFK
- MANE Select -transkripti
- ENST00000376736.6NM_018339.6
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rfk.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue RFK ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä RFK. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.
RFK-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,6 kb geenin 8,9 kb:stä; 468 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi RFK
2Helppo
Kuinka vaikea RFK on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of RFK's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of RFK's exons in each kind of hard region
- KartoitettavuusAlueet, joilla 100 tai 250 emäsparin lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten varianttikutsu siellä voi puuttua tai olla virheellinen. Paino 35 %.0 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatiot: kopiot muualla genomissa, kuten paraloogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identiteetillä. Paino 30 %.0 %
- ToistotTandem-toistot ja yhden emäksen jaksot, joihin lukemat luisuvat eivätkä ehkä kata. Paino 15 %.1,7 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emäksiä on alle 25 % tai yli 65 %; kirjastovalmistelu kattaa ne ohuesti. Paino 10 %.13 %
- Referenssin kattavuusLähellä olevat aukot referenssikokoonpanossa, joissa ei ole sekvenssiä, johon lukemat voisivat kohdistua. Paino 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredJokainen palkki on sen osuus RFK-geenin eksonien emäksistä kyseisessä vaikeassa alueessa. Pistemäärä painottaa niitä sen mukaan, kuinka paljon kukin maksaa lyhyillä lukemilla tehtävässä kutsussa: 0, kun yksikään emäs ei ole missään, 100, kun jokainen emäs on kaikissa niistä.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RFK-geeni: riboflavin kinase. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rfk
Dante Labs. RFK-geeni: riboflavin kinase [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rfk
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa