Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

LRRIQ1

leucine rich repeats and IQ motif containing 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
12q21.31
Koordinaatit
Kromosomi 12: 85 036 351–85 245 105 (GRCh38)
Eksonit
27 eksonia 208,8 kb:n alueella
Proteiini
1 722 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FLJ12303, KIAA1801
MANE Select -transkripti
ENST00000393217.7NM_001079910.2
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä LRRIQ1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

LRRIQ1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 12, jossa hakasulke osoittaa LRRIQ1-geenin sijainnin. LRRIQ1 ja 3 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 12, välillä 84 640 728–85 640 727.Kromosomi 1212q21.31p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3384,8 Mb85 Mb85,2 Mb85,4 Mb85,6 MbSLC6A15: 84 859 491–84 913 629, juoste taaksepäinSLC6A15TSPAN19: 85 014 311–85 036 277, juoste taaksepäinTSPAN19LRRIQ1: 85 036 351–85 245 105, juoste eteenpäinLRRIQ1ALX1: 85 280 091–85 302 551, juoste eteenpäinALX1LRRIQ1-kaavio: 27 eksonia kromosomin 12 juosteella, eteenpäinEkson 1: 85 036 351–85 036 407, 57 emästäEkson 2: 85 038 153–85 038 308, 156 emästäEkson 3: 85 040 490–85 040 601, 112 emästäEkson 4: 85 044 718–85 044 809, 92 emästäEkson 5: 85 046 020–85 046 137, 118 emästäEkson 6: 85 047 247–85 047 470, 224 emästäEkson 7: 85 052 177–85 052 251, 75 emästäEkson 8: 85 055 547–85 057 184, 1 638 emästäEkson 9: 85 065 262–85 065 414, 153 emästäEkson 10: 85 066 748–85 066 898, 151 emästäEkson 11: 85 072 907–85 073 098, 192 emästäEkson 12: 85 098 355–85 098 548, 194 emästäEkson 13: 85 098 867–85 098 994, 128 emästäEkson 14: 85 104 004–85 104 077, 74 emästäEkson 15: 85 106 522–85 106 615, 94 emästäEkson 16: 85 121 697–85 121 876, 180 emästäEkson 17: 85 124 070–85 124 519, 450 emästäEkson 18: 85 127 832–85 128 033, 202 emästäEkson 19: 85 137 850–85 137 969, 120 emästäEkson 20: 85 152 280–85 152 369, 90 emästäEkson 21: 85 153 024–85 153 145, 122 emästäEkson 22: 85 153 663–85 153 758, 96 emästäEkson 23: 85 154 012–85 154 094, 83 emästäEkson 24: 85 160 613–85 160 714, 102 emästäEkson 25: 85 229 517–85 229 649, 133 emästäEkson 26: 85 232 696–85 232 756, 61 emästäEkson 27: 85 244 789–85 245 105, 317 emästä1510152025275′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 5,4 kb geenin 208,8 kb:stä; 5 169 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

LRRIQ1-geenin sekvensointi

3Helppo

Kuinka vaikea LRRIQ1-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki LRRIQ1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa LRRIQ1-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot4,8 %
  • GC-pitoisuus10 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). LRRIQ1-geeni: leucine rich repeats and IQ motif containing 1. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/lrriq1

Vancouver

Dante Labs. LRRIQ1-geeni: leucine rich repeats and IQ motif containing 1 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/lrriq1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test