Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

LRFN5

leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
14q21.1
Koordinaatit
Kromosomi 14: 41 606 876–41 904 549 (GRCh38)
Eksonit
6 eksonia 297,7 kb:n alueella
Proteiini
719 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FIGLER8, SALM5
Aiemmat symbolit
C14orf146
MANE Select -transkripti
ENST00000298119.9NM_152447.5
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä LRFN5. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

LRFN5-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 14, jossa hakasulke osoittaa LRFN5-geenin sijainnin. LRFN5 ja 0 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 14, välillä 41 255 713–42 255 712.Kromosomi 1414q21.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3341,4 Mb41,6 Mb41,8 Mb42 Mb42,2 MbLRFN5: 41 606 876–41 904 549, juoste eteenpäinLRFN5LRFN5-kaavio: 6 eksonia kromosomin 14 juosteella, eteenpäinEkson 1: 41 606 876–41 608 562, 1 687 emästäEkson 2: 41 766 854–41 767 029, 176 emästäEkson 3: 41 886 606–41 888 010, 1 405 emästäEkson 4: 41 891 250–41 891 962, 713 emästäEkson 5: 41 898 917–41 898 960, 44 emästäEkson 6: 41 904 158–41 904 549, 392 emästä12465′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,4 kb geenin 297,7 kb:stä; 2 160 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi LRFN5

3Helppo

Kuinka vaikea LRFN5 on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Almost all of LRFN5's exons sit where short reads map cleanly.

What adds to it: the share of LRFN5's exons in each kind of hard region

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot8,4 %
  • GC-pitoisuus16 %
  • Referenssin kattavuus0 %

A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scored

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). LRFN5-geeni: leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/lrfn5

Vancouver

Dante Labs. LRFN5-geeni: leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/lrfn5

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test