Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

FBXL17

F-box and leucine rich repeat protein 17

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5q21.3
Koordinaatit
Kromosomi 5: 107 859 035–108 382 098 (GRCh38)
Eksonit
9 eksonia 523,1 kb:n alueella
Proteiini
701 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
DKFZP434C1715, Fbx13, Fbl17
Aiemmat symbolit
FBXO13
MANE Select -transkripti
ENST00000542267.7NM_001163315.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä FBXL17. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

FBXL17-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa FBXL17-geenin sijainnin. FBXL17 ja 2 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 107 335 971–108 905 162.Kromosomi 55q21.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3107,4 Mb107,6 Mb107,8 Mb108 Mb108,2 Mb108,4 Mb108,6 Mb108,8 MbEFNA5: 107 376 894–107 671 043, juoste taaksepäinEFNA5FBXL17: 107 859 035–108 382 098, juoste taaksepäinFBXL17FER: 108 747 841–109 196 841, juoste eteenpäinFERFBXL17-kaavio: 9 eksonia kromosomin 5 juosteella, taaksepäinEkson 9: 107 859 035–107 861 860, 2 826 emästäEkson 8: 107 881 037–107 881 179, 143 emästäEkson 7: 108 020 925–108 021 001, 77 emästäEkson 6: 108 186 117–108 186 247, 131 emästäEkson 5: 108 224 121–108 224 228, 108 emästäEkson 4: 108 348 399–108 348 530, 132 emästäEkson 3: 108 364 738–108 364 995, 258 emästäEkson 2: 108 367 831–108 367 953, 123 emästäEkson 1: 108 380 699–108 382 098, 1 400 emästä9864215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 5,2 kb geenin 523,1 kb:stä; 2 106 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

FBXL17-geenin sekvensointi

8Helppo

Kuinka vaikea FBXL17-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki FBXL17-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa FBXL17-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot6 %
  • GC-pitoisuus32 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). FBXL17-geeni: F-box and leucine rich repeat protein 17. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/fbxl17

Vancouver

Dante Labs. FBXL17-geeni: F-box and leucine rich repeat protein 17 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/fbxl17

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test