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Gen

TPD52L1

TPD52 like 1

Resumen

Localización citogenética
6q22.31
Coordenadas
Cromosoma 6: 125.153.773–125.264.407 (GRCh38)
Exones
7 exones en 110,6 kb
Proteína
204 aminoácidos
También conocido como
D53, hD53, TPD53
Transcrito MANE Select
ENST00000534000.6NM_003287.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún TPD52L1. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de TPD52L1

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 6, con un corchete donde se ubica TPD52L1. TPD52L1 y 3 genes cercanos en el cromosoma 6, desde 124.709.090 hasta 125.709.089.Cromosoma 66q22.31p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27124,8 Mb125 Mb125,2 Mb125,4 Mb125,6 MbNKAIN2: 123.803.812–124.825.739, hebra directaNKAIN2RNF217: 124.961.875–125.092.633, hebra directaRNF217TPD52L1: 125.153.773–125.264.407, hebra directaTPD52L1HDDC2: 125.219.962–125.302.146, hebra inversaHDDC2Diagrama de TPD52L1: 7 exones en la hebra directa del cromosoma 6Exón 1: 125.153.773–125.153.970, 198 basesExón 2: 125.220.078–125.220.193, 116 basesExón 3: 125.229.118–125.229.266, 149 basesExón 4: 125.248.282–125.248.383, 102 basesExón 5: 125.253.717–125.253.755, 39 basesExón 6: 125.257.098–125.257.158, 61 basesExón 7: 125.262.834–125.264.407, 1574 bases12345675′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 2,2 kb de los 110,6 kb del gen; 615 de esas bases codifican la proteína.

Secuenciación de TPD52L1

7Fácil

Dificultad de secuenciar TPD52L1 con lecturas cortas, sobre 100

Casi todos los exones de TPD52L1 están donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.

Lo que lo agrava: la proporción de exones de TPD52L1 en cada tipo de región difícil

  • Mapeabilidad0 %
  • Homología0 %
  • Compartido con chrY0 %
  • Cobertura de referencia0 %
  • Repeticiones3,9 %
  • Contenido GC27 %

Una puntuación de Dante Labs basada en investigación propia, construida sobre los mapas de regiones de difícil secuenciación Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúa

Enlaces externos

De dónde procede

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen TPD52L1: TPD52 like 1. Consultado el 19 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/tpd52l1

Vancouver

Dante Labs. Gen TPD52L1: TPD52 like 1 [Internet]. [citado 19 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/tpd52l1

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