Gen
ATM
ATM serine/threonine kinase
- HGNC 795↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000149311↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 472↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 11q22.3
- Coordenadas
- Cromosoma 11: 108.223.067–108.369.102 (GRCh38)
- Exones
- 63 exones en 146 kb
- Proteína
- 3056 aminoácidos, 350,7 kDa
- También conocido como
- TEL1, TELO1
- Símbolos anteriores
- ATA, ATDC, ATC, ATD
- Transcrito MANE Select
- ENST00000675843.1NM_000051.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
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Ataxia-telangiectasia
- Autosómica recesiva
Ataxia cerebelosa progresiva, telangiectasia, inmunodeficiencia y predisposición al cáncer causadas por alteraciones bialélicas en ATM.
- ClinGen clasifica la asociación como definitiva
- 8 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
▶Accionabilidad
El diagnóstico orienta la prevención de infecciones y la terapia de reemplazo con inmunoglobulinas, la reducción de la exposición a radiaciones ionizantes, la vigilancia del cáncer y de los pulmones, y el estudio de portadores en familiares.
Infertilidad femenina
Capacidad disminuida o ausente de una mujer para lograr la concepción.
- ClinGen clasifica la asociación como definitiva
- 8 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
Genes del cáncer de mama y de ovario distintos de BRCA1/2
- Predisposición al cáncer relacionada con ATMAutosómica dominante
Una única variante en ATM aumenta moderadamente el riesgo de cáncer de mama y se asocia con el cáncer de páncreas y de próstata.
- ClinGen clasifica la asociación como definitiva
- 1 remitente de GenCC la clasifica como definitiva o fuerte
▶Accionabilidad
Generalmente se recomienda un cribado mamario reforzado; los portadores cuya pareja también porte una variante en ATM pueden desear conocer el riesgo de ataxia-telangiectasia en sus hijos.
- Cáncer de mama hereditarioAutosómica dominante
Susceptibilidad hereditaria al cáncer de mama causada por variantes en uno de varios genes.
- 2 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
▶Accionabilidad
Según el gen, puede recomendarse un cribado mamario más temprano e intensivo, que incluya resonancia magnética.
Agrupaciones más amplias
Otros errores innatos de la inmunidad
- Enfermedad por inmunodeficiencia
Uno de 170 genes relacionados con ello
Enfermedad en la que existe una deficiencia o un defecto en los mecanismos inmunitarios, ya sean celulares o humorales.
- ClinGen clasifica la asociación como definitiva
- 8 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
▶Accionabilidad
TCMH para la IDCG y las IDP graves; terapia sustitutiva con inmunoglobulinas (IVIG/SCIG) para las deficiencias de anticuerpos; leniolisib (Joenja, FDA 2023) para el APDS; terapia génica para la IDCG por deficiencia de ADA; abatacept para la deficiencia de CTLA4/LRBA; profilaxis antibiótica; G-CSF para la EGC
Trastornos neurodegenerativos hereditarios
- Trastorno neurodegenerativo relacionado con KIF5AAutosómica dominante
Uno de 372 genes relacionados con ello
Causado por cambios en una copia de KIF5A, gen que codifica una proteína motora con una cola de unión a carga. Distintos tipos de cambio dan lugar a diferentes afecciones: paraplejía espástica hereditaria tipo 10, una forma axonal de la enfermedad de Charcot-Marie-Tooth y esclerosis lateral amiotrófica (ELA).
- ClinGen clasifica la asociación como definitiva
- 8 remitentes de GenCC la clasifican como definitiva o fuerte
▶Accionabilidad
El tratamiento es sintomático y depende de la presentación, e incluye fisioterapia, medicamentos antiespásticos y atención multidisciplinar para la ELA. Cada hijo de una persona afectada tiene una probabilidad de 1 entre 2 de heredar el cambio; el asesoramiento genético ayuda a las familias a comprender esto.
Estructura de ATM
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
- Variantes con una página
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 12,9 kb de los 146 kb del gen; 9171 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de ATM
2Fácil
Dificultad de secuenciar ATM con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Casi todos los exones de ATM están donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.
Lo que lo agrava: la proporción de exones de ATM en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos en los que las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 100.0,5 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con un 90 % de identidad o más. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 60.0 %
- Compartido con chrYLas regiones pseudoautosómicas y la región transpuesta de X, donde chrX y chrY tienen la misma secuencia o casi la misma, por lo que una lectura de uno puede ubicarse en el otro. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 60.0 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia a la que las lecturas puedan alinearse. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 50.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y pueden no abarcarlos. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 30.2,1 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma escasa. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 20.5,4 %
Una puntuación de Dante Labs basada en investigación propia, construida sobre los mapas de regiones de difícil secuenciación Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de exones de ATM que están en ese tipo de región difícil. Cualquier tipo puede por sí solo hacer difícil un gen, y cada tipo adicional suma menos: 0 cuando ninguna base está en ninguno, 100 cuando todas las bases están donde las lecturas no pueden ubicarse de forma única.
2935
posiciones en ATM donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
11 de ellos (0,4 %) caen en regiones en las que las lecturas cortas tienen dificultades.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (11 sitios)
Un genoma completo cubre los 146 kb de ATM, con intrones incluidos, y no solo los 12,9 kb de exones.
Variantes con una página (811)
Las variantes de ATM con una página aquí, primero las de más estrellas de revisión. Cada página describe el registro público de ClinVar sobre la variante, nunca un resultado.
| Variante | HGVS c. | Exón o intrón | Posición (GRCh38) | Clasificación en ClinVar | Estado de revisión |
|---|---|---|---|---|---|
| A911Rfs*19 | c.2730_2731insAG | Exón 18 | 108.268.501 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| c.2T>C | Exón 2 | 108.227.626 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.332-1G>A | Intrón 4 | 108.235.669 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.496+5G>A | Intrón 5 | 108.235.839 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1122_1123del | Exón 9 | 108.248.987 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1607+1G>T | Intrón 10 | 108.251.073 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.2251-2A>T | Intrón 14 | 108.257.479 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.2251-4A>G | Intrón 14 | 108.257.477 | Probablemente patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.2466+5G>C | Intrón 16 | 108.259.080 | Probablemente patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.2639-23_2639-21del | Intrón 17 | 108.268.386 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
Variantes patogénicas de ClinVar (3833)
Las variantes del gen ATM que ClinVar clasifica como patogénicas o probablemente patogénicas para cualquier afección, revisadas por al menos un remitente con criterios, y las más revisadas de ellas. Es el registro público de ClinVar sobre el gen, nunca un resultado.
- Patogénica 2826
- Patogénica/probablemente patogénica 278
- Probablemente patogénica 729
| Variante | Afecciones | Clasificación en ClinVar | Estado de revisión |
|---|---|---|---|
| NM_000051.4(ATM):c.2T>C (p.Met1Thr) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.67C>T (p.Arg23Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.217_218del (p.Glu73fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.332-1G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.387del (p.Asp130fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.467G>A (p.Trp156Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.480_484del (p.Gln161fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.496+5G>A | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.748C>T (p.Arg250Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.790del (p.Tyr264fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.824del (p.Ser274_Leu275insTer) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1122_1123del (p.Glu376fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1158del (p.Lys387fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1355del (p.Thr452fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1396C>T (p.Gln466Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1402_1403del (p.Lys468fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1442T>G (p.Leu481Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1564_1565del (p.Glu522fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1607+1G>T | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.1782del (p.Val595fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.2152dup (p.Cys718fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.2251-2A>T | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.2284_2285del (p.Leu762fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.2413C>T (p.Arg805Ter) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| NM_000051.4(ATM):c.2508dup (p.Ser837fs) | ATM-related cancer predisposition | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
Vea las 3833 junto con todas las demás variantes de ATM en ClinVar → (se abre en una pestaña nueva)
Genes vinculados a las mismas afecciones
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 1Comparte 2 afecciones
- TWNKtwinkle mtDNA helicaseComparte 2 afecciones
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Comparte 1 afección
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialComparte 1 afección
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Comparte 1 afección
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Comparte 1 afección
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseComparte 1 afección
- ACER3alkaline ceramidase 3Comparte 1 afección
- ACO2aconitase 2Comparte 1 afección
- ADAadenosine deaminaseComparte 1 afección
- ADARadenosine deaminase RNA specificComparte 1 afección
- ADPRSADP-ribosylserine hydrolaseComparte 1 afección
Rasgos asociados a ATM
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que ATM puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Choreoathetosis
- Glioblastoma multiforme
Mostrar 29 rasgos más
- Tremor
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Delayed speech and language development
- Depression
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Epilepsy
- Inability to walk
- Intention tremor
- Irritability
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Slurred speech
- Abnormal pyramidal sign
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Cognitive impairment
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
- Diminished deep tendon reflex
- Dystonia
- Jerking
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- B-cell lymphoma
- Decreased blood lymphocyte number
- Acute lymphoblastic leukemia
- Bone marrow disease
- Gastrointestinal bleeding
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Decreased total CD4+ T cell proportion
Mostrar 3 rasgos más
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal fallopian tube morphology
- Ovarian cancer
- Polycystic ovaries
- Abnormality of the testis
- Prostate cancer
- Urinary tract neoplasm
- Uterine cancer
- Abnormal sperm development
Mostrar 1 rasgo más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-21: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista de hallazgos secundarios del ACMG, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de los datos 2026.10.21-c791e85a.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen ATM: ATM serine/threonine kinase. Consultado el 23 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/atm
Dante Labs. Gen ATM: ATM serine/threonine kinase [Internet]. [citado 23 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/atm
Una prueba. Respuestas para toda la vida.
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